معرفی شرکت ها
ampliconnoise_1.29-10+b2_mips64el.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main mips64el |
| نام بسته | ampliconnoise |
| نام فایل بسته | ampliconnoise_1.29-10+b2_mips64el.deb |
| نسخه بسته | 1.29 |
| انتشار بسته | 10+b2 |
| معماری بسته | mips64el |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/lanzen/ampliconnoise |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1101484 |
| حجم نصب | 2423 |
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput
sequence data. It consists of three main parts:
.
Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads
SeqNoise - removes PCR point mutations
Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference
sequences
.
Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and
this package includes an updated version. There is also a "Denoiser"
in Qiime which is related but distinct.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| ampliconnoise_1.29-10+b2_amd64.deb | 1.29 | amd64 | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_arm64.deb | 1.29 | arm64 | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_armel.deb | 1.29 | armel | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_armhf.deb | 1.29 | armhf | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_i386.deb | 1.29 | i386 | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_mipsel.deb | 1.29 | mipsel | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_ppc64el.deb | 1.29 | ppc64el | Debian main |
| ampliconnoise_1.29-10+b2_s390x.deb | 1.29 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.34 | libc6 |
| >= 2.7.1 | libgsl27 |
| >= 4.1.4 | libopenmpi3 |
| - | mafft |
نحوه نصب
نصب پکیج deb ampliconnoise:
sudo apt-get install ampliconnoise_1.29-10+b2_mips64el.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/FCluster |
| ./usr/bin/FastaUnique |
| ./usr/bin/NDist |
| ./usr/bin/Perseus |
| ./usr/bin/PerseusD |
| ./usr/bin/PyroDist |
| ./usr/bin/PyroNoise |
| ./usr/bin/PyroNoiseA |
| ./usr/bin/PyroNoiseM |
| ./usr/bin/SeqDist |
| ./usr/bin/SeqNoise |
| ./usr/bin/SplitClusterClust |
| ./usr/bin/SplitClusterEven |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp_E123.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp_Titanium.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/TranN.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran_D.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran_V6.dat |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CSV.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Class.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Clean.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Clean360.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanAcyclic.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanBoth.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanBothM.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanMinMax.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanMinMax.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/ConvertDatFasta.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CountFasta.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CountSequences.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Diversity.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FilterGoodClass.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsFA.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsFA360.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsMinMax.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Join.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Map.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/MedianS.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Parse.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/ParseBoth.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime_OTU.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime_Typical.pl |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunBoth.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunBothFLX.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunFLX.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunTitanium.sh |
| ./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunTitaniumA.sh |
| ... and 37 more |