معرفی شرکت ها


samtools_1.16.1-1_armel.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main armel
نام بسته samtools
نام فایل بسته samtools_1.16.1-1_armel.deb
نسخه بسته 1.16.1
انتشار بسته 1
معماری بسته armel
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.htslib.org/
مجوز -
حجم دانلود 572188
حجم نصب 1573
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
samtools-test_1.16.1-1_all.deb 1.16.1 all Debian main
samtools_1.16.1-1_amd64.deb 1.16.1 amd64 Debian main
samtools_1.16.1-1_arm64.deb 1.16.1 arm64 Debian main
samtools_1.16.1-1_armhf.deb 1.16.1 armhf Debian main
samtools_1.16.1-1_i386.deb 1.16.1 i386 Debian main
samtools_1.16.1-1_mips64el.deb 1.16.1 mips64el Debian main
samtools_1.16.1-1_mipsel.deb 1.16.1 mipsel Debian main
samtools_1.16.1-1_ppc64el.deb 1.16.1 ppc64el Debian main
samtools_1.16.1-1_s390x.deb 1.16.1 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.34 libc6
>= 1.16 libhts3
>= 6 libncurses6
>= 6 libtinfo6
>= 1:1.2.3.3 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb samtools:

    sudo apt-get install samtools_1.16.1-1_armel.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ace2sam
./usr/bin/blast2sam.pl
./usr/bin/bowtie2sam.pl
./usr/bin/export2sam.pl
./usr/bin/fasta-sanitize.pl
./usr/bin/interpolate_sam.pl
./usr/bin/maq2sam-long
./usr/bin/maq2sam-short
./usr/bin/md5fa
./usr/bin/md5sum-lite
./usr/bin/novo2sam.pl
./usr/bin/plot-ampliconstats
./usr/bin/plot-bamstats
./usr/bin/psl2sam.pl
./usr/bin/sam2vcf.pl
./usr/bin/samtools
./usr/bin/samtools.pl
./usr/bin/seq_cache_populate.pl
./usr/bin/soap2sam.pl
./usr/bin/wgsim
./usr/bin/wgsim_eval.pl
./usr/bin/zoom2sam.pl
./usr/share/commonwl/samtools-faidx.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-index.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-rmdup.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-sort.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-view.cwl
./usr/share/doc/samtools/AUTHORS
./usr/share/doc/samtools/NEWS.Debian.gz
./usr/share/doc/samtools/README.Debian
./usr/share/doc/samtools/README.gz
./usr/share/doc/samtools/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/samtools/changelog.gz
./usr/share/doc/samtools/copyright
./usr/share/doc/samtools/examples/00README.txt
./usr/share/doc/samtools/examples/ex1.fa
./usr/share/doc/samtools/examples/ex1.sam.gz
./usr/share/doc/samtools/examples/toy.fa
./usr/share/doc/samtools/examples/toy.sam
./usr/share/lintian/overrides/samtools
./usr/share/man/man1/ace2sam.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-addreplacerg.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-ampliconclip.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-ampliconstats.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-bedcov.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-calmd.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-cat.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-collate.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-consensus.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-coverage.1.gz
... and 33 more