معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

دانلود نسخه باینری

توضیحات

VCF parser based on htslib (Python 3)

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	Linux
توزیع	Debian Bookworm-12
مخزن	Debian main armhf
نام بسته	python3-cyvcf2
نام فایل بسته	python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_armhf.deb
نسخه بسته	0.30.18
انتشار بسته	1+b2
معماری بسته	armhf
نگهدارنده	Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت	-
هاست سازنده	-
نوع بسته	.deb
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/brentp/cyvcf2
مجوز	-
حجم دانلود	772196
حجم نصب	4452

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data. . cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use. . This package installs the library for Python 3.

جایگزین ها

بسته	نسخه	معماری	مخزن
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_amd64.deb	0.30.18	amd64	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_arm64.deb	0.30.18	arm64	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_armel.deb	0.30.18	armel	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_i386.deb	0.30.18	i386	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_mips64el.deb	0.30.18	mips64el	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_mipsel.deb	0.30.18	mipsel	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_ppc64el.deb	0.30.18	ppc64el	Debian main
python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_s390x.deb	0.30.18	s390x	Debian main

نیازمندی

مقدار	نام
>= 1:1.22.0	python3-numpy
-	python3-numpy-abi9
<< 3.12	python3
>= 3.11~	python3
-	python3-click
-	python3-coloredlogs
-	python3:any
>= 2.7	libc6
>= 1.10	libhts3

نحوه نصب

نصب پکیج deb python3-cyvcf2:

sudo apt-get install python3-cyvcf2_0.30.18-1+b2_armhf.deb

فایل ها

مسیرها
./usr/bin/cyvcf2
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/__main__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cli.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.c
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.cpython-311-arm-linux-gnueabihf.so
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.pxd
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.pyx
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/helpers.c
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/helpers.h
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/relatedness.h
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/bug.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/decomposed.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/empty.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/issue_198.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/issue_44.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/no-seq-len.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/no-seq-names.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/o.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/seg.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-alt-repr.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-diff.csi
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-format-string.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-genotypes.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-haploidX.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-hemi.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-invalid-header.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-multiallelic-homozygous-alt.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-multiallelic-homozygous-alt.vcf.gz.tbi
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-strict-gt-option-flag.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-strict-gt-option-flag.vcf.gz.tbi
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.bug.117.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.comp_het.3.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.isa.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.mnp.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.bcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.bcf.csi
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.vcf.gz.tbi
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_cli.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_gt_alt_freqs.vcf
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_gt_bases.vcf.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_hemi.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_reader.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_writer.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.18.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/python3-cyvcf2/changelog.Debian.armhf.gz
./usr/share/doc/python3-cyvcf2/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/python3-cyvcf2/changelog.gz
./usr/share/doc/python3-cyvcf2/copyright
./usr/share/man/man1/cyvcf2.1.gz