معرفی شرکت ها

nanopolish_0.14.0-1_arm64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

consensus caller for nanopore sequencing data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main arm64
نام بسته nanopolish
نام فایل بسته nanopolish_0.14.0-1_arm64.deb
نسخه بسته 0.14.0
انتشار بسته 1
معماری بسته arm64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/jts/nanopolish
مجوز -
حجم دانلود 2134472
حجم نصب 9218
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
nanopolish_0.14.0-1_amd64.deb 0.14.0 amd64 Debian main
nanopolish_0.14.0-1_armel.deb 0.14.0 armel Debian main
nanopolish_0.14.0-1_armhf.deb 0.14.0 armhf Debian main
nanopolish_0.14.0-1_i386.deb 0.14.0 i386 Debian main
nanopolish_0.14.0-1_mips64el.deb 0.14.0 mips64el Debian main
nanopolish_0.14.0-1_mipsel.deb 0.14.0 mipsel Debian main
nanopolish_0.14.0-1_ppc64el.deb 0.14.0 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.3.1 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
- libhdf5-103-1
>= 1.10 libhts3
>= 0.5.1+dfsg libslow5-0
>= 11 libstdc++6
>= 0.4.1 libstreamvbyte0
>= 1:1.1.4 zlib1g
- python3:any
- perl:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb nanopolish:

    sudo apt-get install nanopolish_0.14.0-1_arm64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/nanopolish
./usr/bin/nanopolish_makerange
./usr/lib/nanopolish/calculate_methylation_frequency.py
./usr/lib/nanopolish/consensus-preprocess.pl
./usr/lib/nanopolish/consensus.make
./usr/lib/nanopolish/convert_all_models.py
./usr/lib/nanopolish/convert_model_to_header.py
./usr/lib/nanopolish/dropmodel.py
./usr/lib/nanopolish/extract_reads_aligned_to_region.py
./usr/lib/nanopolish/import_ont_model.py
./usr/lib/nanopolish/import_ont_models_from_dir.sh
./usr/lib/nanopolish/nanopolish_makerange.py
./usr/lib/nanopolish/nanopolish_merge.py
./usr/lib/nanopolish/nanopolish_test
./usr/lib/nanopolish/polya_training/dump_signal.py
./usr/lib/nanopolish/polya_training/environment.yml
./usr/lib/nanopolish/polya_training/hmmplot.py
./usr/lib/nanopolish/polya_training/retrain_emission.py
./usr/lib/nanopolish/polya_training/workflow.md
./usr/lib/nanopolish/reestimate_polya_emissions.py
./usr/lib/nanopolish/requirements.txt
./usr/share/doc/nanopolish/README.Debian
./usr/share/doc/nanopolish/README.md.gz
./usr/share/doc/nanopolish/README.test
./usr/share/doc/nanopolish/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/nanopolish/copyright
./usr/share/doc/nanopolish/examples/data/LomanLabz_PC_Ecoli_K12_R7.3_2549_1_ch8_file30_strand.fast5
./usr/share/doc/nanopolish/run-unit-test
./usr/share/man/man1/nanopolish.1.gz
./usr/share/python3/runtime.d/nanopolish.rtupdate