معرفی شرکت ها

kleborate_2.3.1-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

tool to screen Klebsiella genome assemblies
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته kleborate
نام فایل بسته kleborate_2.3.1-2_amd64.deb
نسخه بسته 2.3.1
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/katholt/Kleborate
مجوز -
حجم دانلود 7740008
حجم نصب 62139
Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for: . * MLST sequence type * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.) * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt), colibactin (clb) * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2) * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs and colistin resistance truncations * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles and Kaptive


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
kleborate-examples_2.3.1-2_all.deb 2.3.1 all Debian main
kleborate_2.3.1-2_arm64.deb 2.3.1 arm64 Debian main
kleborate_2.3.1-2_mips64el.deb 2.3.1 mips64el Debian main
kleborate_2.3.1-2_ppc64el.deb 2.3.1 ppc64el Debian main
kleborate_2.3.1-2_s390x.deb 2.3.1 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- python3-biopython
- python3:any
- ncbi-blast+
- mash
- kaptive
- kaptive-data
- python3-distutils


نحوه نصب


نصب پکیج deb kleborate:

    sudo apt-get install kleborate_2.3.1-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/kleborate
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.2.0.egg-info/top_level.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/__main__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/blastn.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/contig_stats.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/AbST_profiles.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_AMR_clustered.csv
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.1.13.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.1.13.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.1.13.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.1.13.fasta.nsq
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.1.13.fasta.nto
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CbST_profiles.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp1.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp10.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp11.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp12.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp13.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp14.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp15.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp16.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp17.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp18.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp19.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp2.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp20.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp21.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp22.gff
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp3.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp4.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp5.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp6.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp7.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp8.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp9.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nsq
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nto
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.nsq
... and 68 more