معرفی شرکت ها

ecopcr_1.0.1+dfsg-4_armel.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

estimate PCR barcode primers quality
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main armel
نام بسته ecopcr
نام فایل بسته ecopcr_1.0.1+dfsg-4_armel.deb
نسخه بسته 1.0.1+dfsg
انتشار بسته 4
معماری بسته armel
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://git.metabarcoding.org/obitools/ecopcr/wikis/home
مجوز -
حجم دانلود 53940
حجم نصب 208
DNA barcoding is a tool for characterizing the species origin using a short sequence from a standard position and agreed upon position in the genome. To be used as a DNA barcode, a genome locus should vary among individuals of the same species only to a minor degree and it should vary among species very quickly. From a practical point of view, a barcode locus should be flanked by two conserved regions to design PCR primers. Several manually discovered barcode loci like COI, rbcL, 18S, 16S and 23S rDNA, or trnH-ps are routinely used today, but no objective function has been described to measure their quality in terms of universality (barcode coverage, Bc ) or in terms of taxonomical discrimination capacity (barcode specificity, Bs ). . ecoPCR is an electronic PCR software developed by LECA and Helix-Project. It helps to estimate Barcode primers quality. In conjunction with OBITools you can postprocess ecoPCR output to compute barcode coverage and barcode specificity. New barcode primers can be developed using the ecoPrimers software


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_amd64.deb 1.0.1+dfsg amd64 Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_arm64.deb 1.0.1+dfsg arm64 Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_armhf.deb 1.0.1+dfsg armhf Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_i386.deb 1.0.1+dfsg i386 Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_mips64el.deb 1.0.1+dfsg mips64el Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_mipsel.deb 1.0.1+dfsg mipsel Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_ppc64el.deb 1.0.1+dfsg ppc64el Debian main
ecopcr_1.0.1+dfsg-4_s390x.deb 1.0.1+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 1:1.1.4 zlib1g
- python3:any
- python3-reportlab


نحوه نصب


نصب پکیج deb ecopcr:

    sudo apt-get install ecopcr_1.0.1+dfsg-4_armel.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ecoPCR
./usr/bin/ecoPCRFilter
./usr/bin/ecoPCRFormat
./usr/bin/ecoSort
./usr/bin/ecofind
./usr/bin/ecogrep
./usr/bin/ecoisundertaxon
./usr/share/doc/ecopcr/README.test
./usr/share/doc/ecopcr/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/ecopcr/copyright
./usr/share/doc/ecopcr/run-unit-test
./usr/share/man/man1/ecoPCR.1.gz
./usr/share/man/man1/ecoPCRFormat.1.gz
./usr/share/man/man1/ecofind.1.gz
./usr/share/man/man1/ecogrep.1.gz
./usr/share/man/man1/ecoisundertaxon.1.gz