معرفی شرکت ها

pyfastx_0.8.4-2_mips64el.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

fast random access to sequences from FASTA/Q file - command
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main mips64el
نام بسته pyfastx
نام فایل بسته pyfastx_0.8.4-2_mips64el.deb
نسخه بسته 0.8.4
انتشار بسته 2
معماری بسته mips64el
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/lmdu/pyfastx.git
مجوز -
حجم دانلود 126484
حجم نصب 169
The pyfastx is a lightweight Python C extension that enables users to randomly access to sequences from plain and gzipped FASTA/Q files. This module aims to provide simple APIs for users to extract sequence from FASTA and reads from FASTQ by identifier and index number. The pyfastx will build indexes stored in a sqlite3 database file for random access to avoid consuming excessive amount of memory. In addition, the pyfastx can parse standard (sequence is spread into multiple lines with same length) and nonstandard (sequence is spread into one or more lines with different length) FASTA format. . It features: . * a single file for the Python extension; * lightweight, memory efficient FASTA/Q file parsing; * fast random access to sequences from gzipped FASTA/Q file; * sequences reading from FASTA file line by line; * N50 and L50 calculation of sequences in FASTA file; * GC content and nucleotides composition calculation; * reverse, complement and antisense sequences extraction; * excellent compatibility: support for parsing nonstandard FASTA file; * support for FASTQ quality score conversion; * a command line interface for splitting FASTA/Q file. . This package provides the command line interface.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
pyfastx_0.8.4-2_amd64.deb 0.8.4 amd64 Debian main
pyfastx_0.8.4-2_arm64.deb 0.8.4 arm64 Debian main
pyfastx_0.8.4-2_i386.deb 0.8.4 i386 Debian main
pyfastx_0.8.4-2_ppc64el.deb 0.8.4 ppc64el Debian main
pyfastx_0.8.4-2_s390x.deb 0.8.4 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- python3
- python3-pyfastx


نحوه نصب


نصب پکیج deb pyfastx:

    sudo apt-get install pyfastx_0.8.4-2_mips64el.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/pyfastx
./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastxcli.py
./usr/share/doc/pyfastx/README.rst.gz
./usr/share/doc/pyfastx/README.test
./usr/share/doc/pyfastx/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/pyfastx/copyright
./usr/share/doc/pyfastx/docs/Makefile
./usr/share/doc/pyfastx/docs/make.bat
./usr/share/doc/pyfastx/docs/requirements.txt
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/acknowledgements.rst
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/advance.rst
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/api_reference.rst.gz
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/changelog.rst.gz
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/commandline.rst.gz
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/conf.py
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/drawbacks.rst
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/index.rst
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/installation.rst
./usr/share/doc/pyfastx/docs/source/usage.rst.gz
./usr/share/doc/pyfastx/examples/protein.fa
./usr/share/doc/pyfastx/examples/rna.fa
./usr/share/doc/pyfastx/examples/test.fa.gz
./usr/share/doc/pyfastx/examples/test.fq.gz
./usr/share/doc/pyfastx/test-cli
./usr/share/man/man1/pyfastx.1.gz