معرفی شرکت ها
minia_3.2.6-3_mips64el.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
short-read biological sequence assembler
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main mips64el |
| نام بسته | minia |
| نام فایل بسته | minia_3.2.6-3_mips64el.deb |
| نسخه بسته | 3.2.6 |
| انتشار بسته | 3 |
| معماری بسته | mips64el |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://minia.genouest.org/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 392392 |
| حجم نصب | 843 |
What was referred to as "next-generation" DNA sequencing up to
the year 2020 delivered only "short" reads up to ~600 base pairs
in length that would then have to be puzzled by random overlaps
in their sequence towards a complete genome. This is the genome
assembly. And there are many biological pitfalls on long stretches
of low complexity regions and copy number variations and other
sorts of redundancies that render this difficult.
.
This package provides a short-read DNA sequence assembler based on a
de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop
computer in a day.
.
The output of Minia is a set of contigs, i.e. stretches of gap-free
linear overlaps of short reads. In the best possible case this is
a whole chromosome.
.
Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other
de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| minia_3.2.6-3_amd64.deb | 3.2.6 | amd64 | Debian main |
| minia_3.2.6-3_arm64.deb | 3.2.6 | arm64 | Debian main |
| minia_3.2.6-3_ppc64el.deb | 3.2.6 | ppc64el | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_amd64.deb | 0.3+dfsg | amd64 | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_arm64.deb | 0.3+dfsg | arm64 | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_armel.deb | 0.3+dfsg | armel | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_armhf.deb | 0.3+dfsg | armhf | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_i386.deb | 0.3+dfsg | i386 | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_mips64el.deb | 0.3+dfsg | mips64el | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_mipsel.deb | 0.3+dfsg | mipsel | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_ppc64el.deb | 0.3+dfsg | ppc64el | Debian main |
| miniasm_0.3+dfsg-4_s390x.deb | 0.3+dfsg | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.34 | libc6 |
| >= 1.4.2+dfsg | libgatbcore3 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| - | libhdf5-103-1 |
| >= 11 | libstdc++6 |
| - | zlib1g |
| - | bc |
نحوه نصب
نصب پکیج deb minia:
sudo apt-get install minia_3.2.6-3_mips64el.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/merci |
| ./usr/bin/minia |
| ./usr/share/doc/minia/README.Debian |
| ./usr/share/doc/minia/README.md |
| ./usr/share/doc/minia/README.test |
| ./usr/share/doc/minia/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/minia/copyright |
| ./usr/share/doc/minia/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/minia/test/10k_test.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/1seq.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/1seq_90bp.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/1seq_90bp.reads.fq |
| ./usr/share/doc/minia/test/1seq_90bp_circ.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/1seq_90bp_simulate_reads.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/ERR039477.md5 |
| ./usr/share/doc/minia/test/ERR039477.md5-gcc47 |
| ./usr/share/doc/minia/test/README |
| ./usr/share/doc/minia/test/X.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/X.solution.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/bubble.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/bubble.solution.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/bubble_covmult0.5.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/buchnera.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/minia/test/buchnera_simulate_reads.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/buchnera_test.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/compare_fasta.py |
| ./usr/share/doc/minia/test/ec.fa.gz |
| ./usr/share/doc/minia/test/ec.solution.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/genome10K.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/minia/test/high_abundance.fa.gz |
| ./usr/share/doc/minia/test/read50x_ref10K_e001.fa.gz |
| ./usr/share/doc/minia/test/simple_test.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/test_ERR039477.sh |
| ./usr/share/doc/minia/test/tip.fa |
| ./usr/share/doc/minia/test/tip.solution.fa |
| ./usr/share/man/man1/merci.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/minia.1.gz |