معرفی شرکت ها

cutesv_2.0.2-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

comprehensive discovery of structural variations of genomic sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته cutesv
نام فایل بسته cutesv_2.0.2-1_all.deb
نسخه بسته 2.0.2
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/tjiangHIT/cuteSV
مجوز -
حجم دانلود 32972
حجم نصب 191
Long-read sequencing enables the comprehensive discovery of structural variations (SVs). However, it is still non-trivial to achieve high sensitivity and performance simultaneously due to the complex SV characteristics implied by noisy long reads. . cuteSV is a sensitive, fast and scalable long-read-based SV detection approach. cuteSV uses tailored methods to collect the signatures of various types of SVs and employs a clustering-and-refinement method to analyze the signatures to implement sensitive SV detection. Benchmarks on real Pacific Biosciences (PacBio) and Oxford Nanopore Technology (ONT) datasets demonstrate that cuteSV has better yields and scalability than state-of-the-art tools.


نیازمندی

مقدار نام
- python3-biopython
- python3-cigar
- python3-numpy
- python3-pysam
- python3-vcf
- python3:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb cutesv:

    sudo apt-get install cutesv_2.0.2-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/cuteSV
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/CommandRunner.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_Description.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_forcecalling.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_genotype.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_resolveDUP.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_resolveINDEL.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_resolveINV.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/cuteSV_resolveTRA.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV/diploid_calling.py
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV-2.0.2.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV-2.0.2.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV-2.0.2.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV-2.0.2.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/cuteSV-2.0.2.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/cutesv/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/cutesv/copyright
./usr/share/man/man1/cuteSV.1.gz