معرفی شرکت ها

any2fasta-examples_0.4.2-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

convert various sequence formats to FASTA (example data)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته any2fasta-examples
نام فایل بسته any2fasta-examples_0.4.2-2_all.deb
نسخه بسته 0.4.2
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/tseemann/any2fasta
مجوز -
حجم دانلود 6509616
حجم نصب 6373
Established tools like readseq and seqret from EMBOSS, both create mangled IDs containing | or . characters, and there is no way to fix this behaviour. This resultes in inconsitences between .gbk and .fna versions of files in pipelines. . This script uses only core Perl modules, has no other dependencies like Bioperl or Biopython, and runs very quickly. . It supports the following input formats: . 1. Genbank flat file, typically .gb, .gbk, .gbff (starts with LOCUS) 2. EMBL flat file, typically .embl, (starts with ID) 3. GFF with sequence, typically .gff, .gff3 (starts with ##gff) 4. FASTA DNA, typically .fasta, .fa, .fna, .ffn (starts with >) 5. FASTQ DNA, typically .fastq, .fq (starts with @) 6. CLUSTAL alignments, typically .clw, .clu (starts with CLUSTAL or MUSCLE) 7. STOCKHOLM alignments, typically .sth (starts with # STOCKHOLM) 8. GFA assembly graph, typically .gfa (starts with ^[A-Z]\t) . Files may be compressed with: . 1. gzip, typically .gz 2. bzip2, typically .bz2 3. zip, typically .zip . This package contains some example data for testing.


نیازمندی

مقدار نام
-


نحوه نصب


نصب پکیج deb any2fasta-examples:

    sudo apt-get install any2fasta-examples_0.4.2-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.clw
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.embl
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.fna.gz
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.fq.gz
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.gbk.gz
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.gfa.gz
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.gff.gz
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.noseq.gff
./usr/share/doc/any2fasta/examples/test.sth
./usr/share/doc/any2fasta-examples/README.test
./usr/share/doc/any2fasta-examples/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/any2fasta-examples/copyright
./usr/share/doc/any2fasta-examples/run-unit-test