معرفی شرکت ها
last-align_1447-1+b1_i386.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
genome-scale comparison of biological sequences
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main i386 |
| نام بسته | last-align |
| نام فایل بسته | last-align_1447-1+b1_i386.deb |
| نسخه بسته | 1447 |
| انتشار بسته | 1+b1 |
| معماری بسته | i386 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://gitlab.com/mcfrith/last |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 3984252 |
| حجم نصب | 32226 |
LAST is software for comparing and aligning sequences, typically DNA or
protein sequences. LAST is similar to BLAST, but it copes better with very
large amounts of sequence data. Here are two things LAST is good at:
.
* Comparing large (e.g. mammalian) genomes.
* Mapping lots of sequence tags onto a genome.
.
The main technical innovation is that LAST finds initial matches based on
their multiplicity, instead of using a fixed size (e.g. BLAST uses 10-mers).
This allows one to map tags to genomes without repeat-masking, without becoming
overwhelmed by repetitive hits. To find these variable-sized matches, it uses
a suffix array (inspired by Vmatch). To achieve high sensitivity, it uses a
discontiguous suffix array, analogous to spaced seeds.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| last-align_1447-1+b1_amd64.deb | 1447 | amd64 | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_arm64.deb | 1447 | arm64 | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_armel.deb | 1447 | armel | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_armhf.deb | 1447 | armhf | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_mips64el.deb | 1447 | mips64el | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_mipsel.deb | 1447 | mipsel | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_ppc64el.deb | 1447 | ppc64el | Debian main |
| last-align_1447-1+b1_s390x.deb | 1447 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.34 | libc6 |
| >= 4.2 | libgcc-s1 |
| >= 11 | libstdc++6 |
| >= 1:1.1.4 | zlib1g |
| - | python3 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb last-align:
sudo apt-get install last-align_1447-1+b1_i386.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/fasta-nr |
| ./usr/bin/fastq-interleave |
| ./usr/bin/last-dotplot |
| ./usr/bin/last-map-probs |
| ./usr/bin/last-postmask |
| ./usr/bin/last-train |
| ./usr/bin/maf-convert |
| ./usr/bin/maf-cut |
| ./usr/bin/maf-join |
| ./usr/bin/maf-sort |
| ./usr/bin/maf-swap |
| ./usr/bin/parallel-fasta |
| ./usr/bin/parallel-fastq |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-avx |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-avx2 |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-plain |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-sse |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-sse2 |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-sse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-sse4.1 |
| ./usr/lib/last-align/last-merge-batches-ssse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-avx |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-avx2 |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-plain |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-sse |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-sse2 |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-sse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-sse4.1 |
| ./usr/lib/last-align/last-pair-probs-ssse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-split-avx |
| ./usr/lib/last-align/last-split-avx2 |
| ./usr/lib/last-align/last-split-plain |
| ./usr/lib/last-align/last-split-sse |
| ./usr/lib/last-align/last-split-sse2 |
| ./usr/lib/last-align/last-split-sse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-split-sse4.1 |
| ./usr/lib/last-align/last-split-ssse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-avx |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-avx2 |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-plain |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-sse |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-sse2 |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-sse3 |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-sse4.1 |
| ./usr/lib/last-align/last-split5-ssse3 |
| ./usr/lib/last-align/lastal-avx |
| ./usr/lib/last-align/lastal-avx2 |
| ./usr/lib/last-align/lastal-plain |
| ./usr/lib/last-align/lastal-sse |
| ./usr/lib/last-align/lastal-sse2 |
| ... and 99 more |