معرفی شرکت ها

fasttree_2.1.11-2_armhf.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main armhf
نام بسته fasttree
نام فایل بسته fasttree_2.1.11-2_armhf.deb
نسخه بسته 2.1.11
انتشار بسته 2
معماری بسته armhf
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.microbesonline.org/fasttree/
مجوز -
حجم دانلود 168820
حجم نصب 385
FastTree infers approximately-maximum-likelihood phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences. It handles alignments with up to a million of sequences in a reasonable amount of time and memory. For large alignments, FastTree is 100-1,000 times faster than PhyML 3.0 or RAxML 7. . FastTree is more accurate than PhyML 3 with default settings, and much more accurate than the distance-matrix methods that are traditionally used for large alignments. FastTree uses the Jukes-Cantor or generalized time-reversible (GTR) models of nucleotide evolution and the JTT (Jones-Taylor-Thornton 1992) model of amino acid evolution. To account for the varying rates of evolution across sites, FastTree uses a single rate for each site (the "CAT" approximation). To quickly estimate the reliability of each split in the tree, FastTree computes local support values with the Shimodaira-Hasegawa test (these are the same as PhyML 3's "SH-like local supports"). . This package contains a single threaded version (fasttree) and a parallel version which uses OpenMP (fasttreMP).


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
fasttree_2.1.11-2_amd64.deb 2.1.11 amd64 Debian main
fasttree_2.1.11-2_arm64.deb 2.1.11 arm64 Debian main
fasttree_2.1.11-2_armel.deb 2.1.11 armel Debian main
fasttree_2.1.11-2_i386.deb 2.1.11 i386 Debian main
fasttree_2.1.11-2_mips64el.deb 2.1.11 mips64el Debian main
fasttree_2.1.11-2_mipsel.deb 2.1.11 mipsel Debian main
fasttree_2.1.11-2_ppc64el.deb 2.1.11 ppc64el Debian main
fasttree_2.1.11-2_s390x.deb 2.1.11 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 6 libgomp1


نحوه نصب


نصب پکیج deb fasttree:

    sudo apt-get install fasttree_2.1.11-2_armhf.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/fasttree
./usr/bin/fasttreeMP
./usr/share/doc/fasttree/README.test
./usr/share/doc/fasttree/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/fasttree/changelog.gz
./usr/share/doc/fasttree/copyright
./usr/share/doc/fasttree/run-unit-test
./usr/share/doc/fasttree/test.fasta.gz
./usr/share/doc/fasttree/test.phylip.gz
./usr/share/man/man1/fasttree.1.gz
./usr/share/man/man1/fasttreeMP.1.gz
./usr/bin/FastTree -> fasttree
./usr/share/man/man1/FastTree.1.gz -> fasttree.1.gz