معرفی شرکت ها


centrifuge_1.0.3-11_armel.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

rapid and memory-efficient system for classification of DNA sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main armel
نام بسته centrifuge
نام فایل بسته centrifuge_1.0.3-11_armel.deb
نسخه بسته 1.0.3
انتشار بسته 11
معماری بسته armel
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://ccb.jhu.edu/software/centrifuge/
مجوز -
حجم دانلود 508620
حجم نصب 1653
Centrifuge is a very rapid and memory-efficient system for the classification of DNA sequences from microbial samples, with better sensitivity than and comparable accuracy to other leading systems. The system uses a novel indexing scheme based on the Burrows-Wheeler transform (BWT) and the Ferragina-Manzini (FM) index, optimized specifically for the metagenomic classification problem. Centrifuge requires a relatively small index (e.g., 4.3 GB for ~4,100 bacterial genomes) yet provides very fast classification speed, allowing it to process a typical DNA sequencing run within an hour. Together these advances enable timely and accurate analysis of large metagenomics data sets on conventional desktop computers.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
centrifuge_1.0.3-11_amd64.deb 1.0.3 amd64 Debian main
centrifuge_1.0.3-11_arm64.deb 1.0.3 arm64 Debian main
centrifuge_1.0.3-11_armhf.deb 1.0.3 armhf Debian main
centrifuge_1.0.3-11_i386.deb 1.0.3 i386 Debian main
centrifuge_1.0.3-11_mips64el.deb 1.0.3 mips64el Debian main
centrifuge_1.0.3-11_ppc64el.deb 1.0.3 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.34 libc6
>= 3.5 libgcc-s1
>= 11 libstdc++6
- python3:any
- python3
- hisat2
- jellyfish


نحوه نصب


نصب پکیج deb centrifuge:

    sudo apt-get install centrifuge_1.0.3-11_armel.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/centrifuge
./usr/lib/centrifuge/centrifuge
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-BuildSharedSequence.pl
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-RemoveEmptySequence.pl
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-RemoveN.pl
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-build
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-build-bin
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-class
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-compress.pl
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-download
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-inspect
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-inspect-bin
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-kreport
./usr/lib/centrifuge/centrifuge-sort-nt.pl
./usr/lib/centrifuge/share/centrifuge/indices/Makefile
./usr/share/doc/centrifuge/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/centrifuge/copyright
./usr/share/doc/centrifuge/html/add.css
./usr/share/doc/centrifuge/html/faq.shtml
./usr/share/doc/centrifuge/html/footer.inc.html
./usr/share/doc/centrifuge/html/index.shtml.gz
./usr/share/doc/centrifuge/html/manual.html
./usr/share/doc/centrifuge/html/manual.shtml
./usr/share/doc/centrifuge/html/sidebar.inc.shtml.gz
./usr/share/doc/centrifuge/html/style.css
./usr/share/man/man1/centrifuge-build.1.gz
./usr/share/man/man1/centrifuge-compress.1.gz
./usr/share/man/man1/centrifuge-download.1.gz
./usr/share/man/man1/centrifuge-inspect.1.gz
./usr/share/man/man1/centrifuge.1.gz
./usr/bin/centrifuge-build -> centrifuge
./usr/bin/centrifuge-compress -> centrifuge
./usr/bin/centrifuge-download -> centrifuge
./usr/bin/centrifuge-inspect -> centrifuge