معرفی شرکت ها


tiddit_3.5.2+dfsg-1_arm64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

structural variant calling
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main arm64
نام بسته tiddit
نام فایل بسته tiddit_3.5.2+dfsg-1_arm64.deb
نسخه بسته 3.5.2+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته arm64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/SciLifeLab/TIDDIT
مجوز -
حجم دانلود 218880
حجم نصب 1187
TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs. . TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
tiddit_3.5.2+dfsg-1_amd64.deb 3.5.2+dfsg amd64 Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_armel.deb 3.5.2+dfsg armel Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_armhf.deb 3.5.2+dfsg armhf Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_i386.deb 3.5.2+dfsg i386 Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_mips64el.deb 3.5.2+dfsg mips64el Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_mipsel.deb 3.5.2+dfsg mipsel Debian main
tiddit_3.5.2+dfsg-1_ppc64el.deb 3.5.2+dfsg ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.17 libc6
<< 3.12 python3
>= 3.11~ python3
- python3-numpy
- python3-pysam
- python3:any
- python3-joblib


نحوه نصب


نصب پکیج deb tiddit:

    sudo apt-get install tiddit_3.5.2+dfsg-1_arm64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/tiddit
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/DBSCAN.py
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/__main__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_cluster.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_contig_analysis.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_coverage.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_coverage_analysis.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_signal.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_stats.py
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_variant.cpython-311-aarch64-linux-gnu.so
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit/tiddit_vcf_header.py
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit-3.5.2.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit-3.5.2.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit-3.5.2.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit-3.5.2.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/tiddit-3.5.2.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/tiddit/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/tiddit/copyright
./usr/share/man/man1/tiddit.1.gz