معرفی شرکت ها

r-bioc-grohmm_1.32.0-1_mipsel.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

GRO-seq Analysis Pipeline
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main mipsel
نام بسته r-bioc-grohmm
نام فایل بسته r-bioc-grohmm_1.32.0-1_mipsel.deb
نسخه بسته 1.32.0
انتشار بسته 1
معماری بسته mipsel
نگهدارنده Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/groHMM/
مجوز -
حجم دانلود 4435324
حجم نصب 4513
This BioConductor package provides a pipeline for the analysis of GRO- seq data. Among the more advanced features, r-bioc-grohmm predicts the boundaries of transcriptional activity across the genome de novo using a two-state hidden Markov model (HMM). . The used model essentially divides the genome into transcribed and non- transcribed regions in a strand specific manner. HMMs are used to identify the leading edge of Pol II at genes activated by a stimulus in GRO-seq time course data. This approach allows the genome-wide interrogation of transcription rates in cells.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_amd64.deb 1.32.0 amd64 Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_arm64.deb 1.32.0 arm64 Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_armel.deb 1.32.0 armel Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_armhf.deb 1.32.0 armhf Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_i386.deb 1.32.0 i386 Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_mips64el.deb 1.32.0 mips64el Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_ppc64el.deb 1.32.0 ppc64el Debian main
r-bioc-grohmm_1.32.0-1_s390x.deb 1.32.0 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.2.2.20221110-1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-api-bioc-3.16
- r-cran-mass
>= 0.17.25 r-bioc-s4vectors
>= 2.13.12 r-bioc-iranges
- r-bioc-genomeinfodb
>= 1.31.8 r-bioc-genomicranges
>= 1.15.6 r-bioc-genomicalignments
>= 1.39.7 r-bioc-rtracklayer
>= 2.4 libc6


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-grohmm:

    sudo apt-get install r-bioc-grohmm_1.32.0-1_mipsel.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/groHMM/CITATION
./usr/lib/R/site-library/groHMM/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/groHMM/INDEX
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/groHMM/NEWS
./usr/lib/R/site-library/groHMM/R/groHMM
./usr/lib/R/site-library/groHMM/R/groHMM.rdb
./usr/lib/R/site-library/groHMM/R/groHMM.rdx
./usr/lib/R/site-library/groHMM/doc/groHMM.R
./usr/lib/R/site-library/groHMM/doc/groHMM.Rnw
./usr/lib/R/site-library/groHMM/doc/groHMM.pdf
./usr/lib/R/site-library/groHMM/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/groHMM/extdata/S0mR1.bam
./usr/lib/R/site-library/groHMM/extdata/S40mR1.bam
./usr/lib/R/site-library/groHMM/extdata/Vignette.RData
./usr/lib/R/site-library/groHMM/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/groHMM/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/help/groHMM.rdb
./usr/lib/R/site-library/groHMM/help/groHMM.rdx
./usr/lib/R/site-library/groHMM/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/groHMM/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/groHMM/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/groHMM/libs/groHMM.so
./usr/share/doc/r-bioc-grohmm/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-bioc-grohmm/copyright