معرفی شرکت ها

sra-toolkit_3.0.3+dfsg-6~deb12u1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

utilities for the NCBI Sequence Read Archive
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته sra-toolkit
نام فایل بسته sra-toolkit_3.0.3+dfsg-6~deb12u1_amd64.deb
نسخه بسته 3.0.3+dfsg
انتشار بسته 6~deb12u1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/ncbi/sra-tools/
مجوز -
حجم دانلود 6755716
حجم نصب 17192
Tools for reading the SRA archive, generally by converting individual runs into some commonly used format such as fastq. . The textual dumpers "sra-dump" and "vdb-dump" are provided in this release as an aid in visual inspection. It is likely that their actual output formatting will be changed in the near future to a stricter, more formalized representation[s]. PLEASE DO NOT RELY UPON THE OUTPUT FORMAT SEEN IN THIS RELEASE. . Other tools distributed in this package are: abi-dump, abi-load align-info bam-load cache-mgr cg-load copycat fasterq-dump fastq-dump, fastq-load helicos-load illumina-dump, illumina-load kar kdbmeta latf-load pacbio-load prefetch rcexplain remote-fuser sff-dump, sff-load sra-pileup, sra-sort, sra-stat, srapath srf-load test-sra vdb-config, vdb-copy, vdb-decrypt, vdb-encrypt, vdb-get, vdb-lock, vdb-passwd, vdb-unlock, vdb-validate . The "help" information will be improved in near future releases, and the tool options will become standardized across the set. More documentation will also be provided documentation on the NCBI web site. . Tool options may change in the next release. Version 1 tool options will remain supported wherever possible in order to preserve operation of any existing scripts.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
sra-toolkit_3.0.3+dfsg-6~deb12u1_arm64.deb 3.0.3+dfsg arm64 Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- libbz2-1.0
>= 2.34 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
- libhdf5-103-1
>= 5.12 libmagic1
>= 3.0.2+dfsg libncbi-vdb3
>= 3.0.2+dfsg libncbi-wvdb3
>= 20201101+dfsg libre2-9
>= 3.0.0 libssl3
>= 12 libstdc++6
>= 2.7.4 libxml2
>= 1:1.2.2 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb sra-toolkit:

    sudo apt-get install sra-toolkit_3.0.3+dfsg-6~deb12u1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./etc/ncbi/certs.kfg
./etc/ncbi/debian.kfg
./etc/ncbi/default.kfg
./etc/ncbi/vdb-copy.kfg
./usr/bin/abi-dump
./usr/bin/abi-load
./usr/bin/align-cache
./usr/bin/align-info
./usr/bin/bam-load
./usr/bin/cache-mgr
./usr/bin/ccextract
./usr/bin/cg-load
./usr/bin/check-corrupt
./usr/bin/copycat
./usr/bin/crc32sum
./usr/bin/dump-blob-boundaries
./usr/bin/fastconv
./usr/bin/fastq-load
./usr/bin/general-loader
./usr/bin/helicos-load
./usr/bin/illumina-dump
./usr/bin/illumina-load
./usr/bin/kar
./usr/bin/kar+
./usr/bin/kar+meta
./usr/bin/kdb-index
./usr/bin/kdbmeta
./usr/bin/latf-load
./usr/bin/make-read-filter
./usr/bin/md5cp
./usr/bin/meta-cmp
./usr/bin/meta-copy
./usr/bin/ngs-pileup
./usr/bin/pacbio-correct
./usr/bin/pacbio-load
./usr/bin/pacbio-loadxml
./usr/bin/pileup-stats
./usr/bin/rcexplain
./usr/bin/read-filter-redact
./usr/bin/ref-variation
./usr/bin/rowwritetest
./usr/bin/samview
./usr/bin/samview-util
./usr/bin/schema-replace
./usr/bin/sff-dump
./usr/bin/sff-load
./usr/bin/sharq
./usr/bin/sortreadtest
./usr/bin/sra-search
./usr/bin/sra-sort
... and 45 more