معرفی شرکت ها

smalt_0.7.6-12_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Sequence Mapping and Alignment Tool
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته smalt
نام فایل بسته smalt_0.7.6-12_amd64.deb
نسخه بسته 0.7.6
انتشار بسته 12
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.sanger.ac.uk/science/tools/smalt-0
مجوز -
حجم دانلود 114720
حجم نصب 307
SMALT efficiently aligns DNA sequencing reads with a reference genome. Reads from a wide range of sequencing platforms, for example Illumina, Roche-454, Ion Torrent, PacBio or ABI-Sanger, can be processed including paired reads. . The software employs a perfect hash index of short words (< 20 nucleotides long), sampled at equidistant steps along the genomic reference sequences. . For each read, potentially matching segments in the reference are identified from seed matches in the index and subsequently aligned with the read using a banded Smith-Waterman algorithm. . The best gapped alignments of each read is reported including a score for the reliability of the best mapping. The user can adjust the trade-off between sensitivity and speed by tuning the length and spacing of the hashed words. . A mode for the detection of split (chimeric) reads is provided. Multi-threaded program execution is supported.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
smalt-examples_0.7.6-12_all.deb 0.7.6 all Debian main
smalt_0.7.6-12_arm64.deb 0.7.6 arm64 Debian main
smalt_0.7.6-12_armel.deb 0.7.6 armel Debian main
smalt_0.7.6-12_armhf.deb 0.7.6 armhf Debian main
smalt_0.7.6-12_i386.deb 0.7.6 i386 Debian main
smalt_0.7.6-12_mips64el.deb 0.7.6 mips64el Debian main
smalt_0.7.6-12_mipsel.deb 0.7.6 mipsel Debian main
smalt_0.7.6-12_ppc64el.deb 0.7.6 ppc64el Debian main
smalt_0.7.6-12_s390x.deb 0.7.6 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 0.0.50 libbambamc0
>= 2.29 libc6
>= 1:1.2.0.2 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb smalt:

    sudo apt-get install smalt_0.7.6-12_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/smalt
./usr/lib/smalt/test/sequenceReverseComplement_test
./usr/share/doc/smalt/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/smalt/copyright
./usr/share/man/man1/smalt.1.gz