معرفی شرکت ها

sga_0.10.15-7+b1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

de novo genome assembler that uses string graphs
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته sga
نام فایل بسته sga_0.10.15-7+b1_amd64.deb
نسخه بسته 0.10.15
انتشار بسته 7+b1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/jts/sga
مجوز -
حجم دانلود 831952
حجم نصب 2432
The major goal of SGA is to be very memory efficient, which is achieved by using a compressed representation of DNA sequence reads. . SGA is a de novo assembler for DNA sequence reads. It is based on Gene Myers' string graph formulation of assembly and uses the FM-index/Burrows-Wheeler transform to efficiently find overlaps between sequence reads.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
sga_0.10.15-7+b1_arm64.deb 0.10.15 arm64 Debian main
sga_0.10.15-7+b1_armel.deb 0.10.15 armel Debian main
sga_0.10.15-7+b1_armhf.deb 0.10.15 armhf Debian main
sga_0.10.15-7+b1_i386.deb 0.10.15 i386 Debian main
sga_0.10.15-7+b1_mips64el.deb 0.10.15 mips64el Debian main
sga_0.10.15-7+b1_mipsel.deb 0.10.15 mipsel Debian main
sga_0.10.15-7+b1_ppc64el.deb 0.10.15 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.5.2+dfsg libbamtools2.5.2
>= 2.34 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
>= 11 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g
- python3:any
- perl:any
- samtools
- python3-ruffus
- python3-pysam


نحوه نصب


نصب پکیج deb sga:

    sudo apt-get install sga_0.10.15-7+b1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/sga
./usr/bin/sga-align
./usr/bin/sga-astat
./usr/bin/sga-bam2de
./usr/bin/sga-mergeDriver
./usr/share/doc/sga/README.Debian
./usr/share/doc/sga/README.gz
./usr/share/doc/sga/README.md
./usr/share/doc/sga/changelog.Debian.amd64.gz
./usr/share/doc/sga/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/sga/copyright
./usr/share/doc/sga/examples/sga-celegans.sh
./usr/share/doc/sga/index.html
./usr/share/man/man1/sga-align.1.gz
./usr/share/man/man1/sga-astat.1.gz
./usr/share/man/man1/sga-bam2de.1.gz
./usr/share/man/man1/sga-mergeDriver.1.gz
./usr/share/man/man1/sga.1.gz