معرفی شرکت ها
r-cran-seurat_4.3.0-1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Tools for Single Cell Genomics
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | r-cran-seurat |
| نام فایل بسته | r-cran-seurat_4.3.0-1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 4.3.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://cran.r-project.org/package=Seurat |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 3061696 |
| حجم نصب | 3579 |
A toolkit for quality control, analysis, and exploration of single cell
RNA sequencing data. 'Seurat' aims to enable users to identify and
interpret sources of heterogeneity from single cell transcriptomic
measurements, and to integrate diverse types of single cell data. See
Satija R, Farrell J, Gennert D, et al (2015) <doi:10.1038/nbt.3192>,
Macosko E, Basu A, Satija R, et al (2015)
<doi:10.1016/j.cell.2015.05.002>, and Butler A and Satija R (2017)
<doi:10.1101/164889> for more details.
جایگزین ها
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-cran-cluster |
| - | r-cran-cowplot |
| - | r-cran-fitdistrplus |
| - | r-cran-future |
| - | r-cran-future.apply |
| >= 3.3.0 | r-cran-ggplot2 |
| - | r-cran-ggrepel |
| - | r-cran-ggridges |
| - | r-cran-httr |
| - | r-cran-ica |
| - | r-cran-igraph |
| - | r-cran-irlba |
| - | r-cran-jsonlite |
| - | r-cran-kernsmooth |
| >= 0.3.1 | r-cran-leiden |
| - | r-cran-lmtest |
| - | r-cran-mass |
| >= 1.5-0 | r-cran-matrix |
| - | r-cran-matrixstats |
| - | r-cran-miniui |
| - | r-cran-patchwork |
| - | r-cran-pbapply |
| >= 4.9.0 | r-cran-plotly |
| - | r-cran-png |
| - | r-cran-progressr |
| - | r-cran-rann |
| - | r-cran-rcolorbrewer |
| >= 1.0.7 | r-cran-rcpp |
| >= 0.0.18 | r-cran-rcppannoy |
| - | r-cran-reticulate |
| - | r-cran-rlang |
| - | r-cran-rocr |
| - | r-cran-rtsne |
| - | r-cran-scales |
| >= 0.7 | r-cran-scattermore |
| >= 0.3.5 | r-cran-sctransform |
| >= 4.1.3 | r-cran-seuratobject |
| - | r-cran-shiny |
| - | r-cran-spatstat.explore |
| - | r-cran-spatstat.geom |
| - | r-cran-tibble |
| >= 0.1.14 | r-cran-uwot |
| - | r-cran-rcppeigen |
| - | r-cran-rcppprogress |
| >= 2.32 | libc6 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| >= 11 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-cran-seurat:
sudo apt-get install r-cran-seurat_4.3.0-1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/NEWS.md |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/R/Seurat |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/R/Seurat.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/R/Seurat.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/data/Rdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/data/Rdata.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/data/Rdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/extdata/pbmc_raw.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/help/Seurat.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/help/Seurat.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/Seurat/libs/Seurat.so |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/copyright |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/barcodes.tsv |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/cr3.0/barcodes.tsv.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/cr3.0/features.tsv.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/cr3.0/matrix.mtx.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/genes.tsv.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/matrix.mtx.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/nbt_small.Rdata.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/visium/filtered_feature_bc_matrix.h5.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/visium/spatial/scalefactors_json.json |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/visium/spatial/tissue_lowres_image.png |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testdata/visium/spatial/tissue_positions_list.csv.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_data_manipulation.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_differential_expression.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_dimensional_reduction.R |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_integratedata.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_integration.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_load_10X.R |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_modularity_optimizer.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_objects.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_preprocessing.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_read_mtx.R |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_transferdata.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_utilities.R.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat/test_visualization.R |
| ./usr/share/doc/r-cran-seurat/tests/testthat.R |