معرفی شرکت ها
r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | r-bioc-tfbstools |
| نام فایل بسته | r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.36.0+dfsg |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/TFBSTools/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1011684 |
| حجم نصب | 1853 |
TFBSTools is a package for the analysis and manipulation of
transcription factor binding sites. It includes matrices conversion
between Position Frequency Matirx (PFM), Position Weight Matirx (PWM)
and Information Content Matrix (ICM). It can also scan putative TFBS
from sequence/alignment, query JASPAR database and provides a wrapper of
de novo motif discovery software.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_arm64.deb | 1.36.0+dfsg | arm64 | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_armel.deb | 1.36.0+dfsg | armel | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_armhf.deb | 1.36.0+dfsg | armhf | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_i386.deb | 1.36.0+dfsg | i386 | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_mips64el.deb | 1.36.0+dfsg | mips64el | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_mipsel.deb | 1.36.0+dfsg | mipsel | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_ppc64el.deb | 1.36.0+dfsg | ppc64el | Debian main |
| r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_s390x.deb | 1.36.0+dfsg | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| >= 2.28 | r-bioc-biobase |
| >= 2.36.4 | r-bioc-biostrings |
| >= 0.14.0 | r-bioc-biocgenerics |
| >= 1.2.21 | r-bioc-biocparallel |
| >= 1.36.3 | r-bioc-bsgenome |
| >= 1.17.1 | r-cran-catools |
| >= 1.4.0 | r-bioc-cner |
| >= 1.10.0 | r-bioc-dirichletmultinomial |
| >= 1.6.1 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.20.6 | r-bioc-genomicranges |
| >= 3.5.0 | r-cran-gtools |
| >= 2.2.7 | r-bioc-iranges |
| >= 0.6 | r-cran-dbi |
| >= 1.0.0 | r-cran-rsqlite |
| >= 1.28.10 | r-bioc-rtracklayer |
| >= 1.34.0 | r-bioc-seqlogo |
| >= 0.9.25 | r-bioc-s4vectors |
| >= 0.0.5 | r-cran-tfmpvalue |
| >= 3.98-1.3 | r-cran-xml |
| >= 0.8.0 | r-bioc-xvector |
| >= 2.4 | libc6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-tfbstools:
sudo apt-get install r-bioc-tfbstools_1.36.0+dfsg-2_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/R/TFBSTools |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/R/TFBSTools.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/R/TFBSTools.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/TFBSToolsBuild/build.r |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/TFBSToolsBuild/build2.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/TFBSToolsBuild/timing.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/data/Rdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/data/Rdata.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/data/Rdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/doc/TFBSTools.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/doc/TFBSTools.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/MA0001.1.pfm |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/crp0.s |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/hg19.danRer7.net.axt |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/meme.output |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/pfm_all_example.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/tffm_detailed.xml |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/extdata/tffm_first_order.xml |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/help/TFBSTools.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/help/TFBSTools.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/libs/TFBSTools.so |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/obsolete/PairwiseAlignmentTFBS-class.Rd |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/obsolete/TFBSTools.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/TFBSTools/obsolete/matrixAligner.c |
| ./usr/share/doc/r-bioc-tfbstools/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-tfbstools/copyright |