معرفی شرکت ها

r-bioc-shortread_1.56.1-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته r-bioc-shortread
نام فایل بسته r-bioc-shortread_1.56.1-1_amd64.deb
نسخه بسته 1.56.1
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/ShortRead/
مجوز -
حجم دانلود 5163460
حجم نصب 7491
This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
r-bioc-shortread_1.56.1-1_arm64.deb 1.56.1 arm64 Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_armel.deb 1.56.1 armel Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_armhf.deb 1.56.1 armhf Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_i386.deb 1.56.1 i386 Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_mips64el.deb 1.56.1 mips64el Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_mipsel.deb 1.56.1 mipsel Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_ppc64el.deb 1.56.1 ppc64el Debian main
r-bioc-shortread_1.56.1-1_s390x.deb 1.56.1 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.2.2.20221110-1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-api-bioc-3.16
>= 0.23.3 r-bioc-biocgenerics
- r-bioc-biocparallel
>= 2.47.6 r-bioc-biostrings
>= 1.31.2 r-bioc-rsamtools
>= 1.15.6 r-bioc-genomicalignments
- r-bioc-biobase
>= 0.17.25 r-bioc-s4vectors
>= 2.13.12 r-bioc-iranges
>= 1.15.2 r-bioc-genomeinfodb
>= 1.31.8 r-bioc-genomicranges
- r-cran-hwriter
- r-bioc-zlibbioc
- r-cran-lattice
- r-cran-latticeextra
- r-bioc-xvector
- r-bioc-rhtslib
>= 2.14 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 11 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-shortread:

    sudo apt-get install r-bioc-shortread_1.56.1-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/CITATION
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/INDEX
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/NEWS
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead.rdb
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead.rdx
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.R
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.Rnw
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.pdf
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_1_sequence.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_2_export.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_5_0001_realign.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_0001_prb.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_0001_seq.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_1_0001_qseq.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/s_1_0001_int.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/s_1_0001_nse.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/E-MTAB-1147/ERR127302_1_subset.fastq.gz
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/E-MTAB-1147/ERR127302_2_subset.fastq.gz
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/bowtie/s_1_aligned_bowtie.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/maq/out.aln.1.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/maq/out.aln.2.txt
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/ShortRead.rdb
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/ShortRead.rdx
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/libs/ShortRead.so
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/script/qa-test.R
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/0000-Header.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/1000-Overview.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/1100-Overview-SolexaRealign.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/2000-RunSummary.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/3000-ReadDistribution.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/4000-CycleSpecific.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/5000-PerTile.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/6000-Alignment.html
./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/7000-MultipleAlignment.html
... and 63 more