معرفی شرکت ها
r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Identify, Annotate and Visualize Alternative Splicing and
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | r-bioc-isoformswitchanalyzer |
| نام فایل بسته | r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.20.0+ds |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/IsoformSwitchAnalyzeR/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 3675668 |
| حجم نصب | 4202 |
Isoform Switches with Functional Consequences from both short- and
long-read RNA-seq data. Analysis of alternative splicing and
isoform switches with predicted functional consequences (e.g.
gain/loss of protein domains etc.) from quantification of all
types of RNASeq by tools such as Kallisto, Salmon, StringTie,
Cufflinks/Cuffdiff etc.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_arm64.deb | 1.20.0+ds | arm64 | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_armel.deb | 1.20.0+ds | armel | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_armhf.deb | 1.20.0+ds | armhf | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_i386.deb | 1.20.0+ds | i386 | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_mips64el.deb | 1.20.0+ds | mips64el | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_mipsel.deb | 1.20.0+ds | mipsel | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_ppc64el.deb | 1.20.0+ds | ppc64el | Debian main |
| r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_s390x.deb | 1.20.0+ds | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| - | r-bioc-limma |
| - | r-bioc-dexseq |
| - | r-cran-ggplot2 |
| - | r-bioc-bsgenome |
| - | r-cran-plyr |
| - | r-cran-reshape2 |
| - | r-cran-gridextra |
| >= 2.50.0 | r-bioc-biostrings |
| - | r-bioc-iranges |
| - | r-bioc-genomicranges |
| - | r-bioc-drimseq |
| - | r-cran-rcolorbrewer |
| - | r-bioc-rtracklayer |
| - | r-cran-venndiagram |
| - | r-cran-dbi |
| - | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.7.1 | r-bioc-tximport |
| >= 1.7.12 | r-bioc-tximeta |
| - | r-bioc-edger |
| - | r-cran-futile.logger |
| - | r-cran-stringr |
| - | r-cran-dplyr |
| - | r-cran-magrittr |
| - | r-cran-readr |
| - | r-cran-tibble |
| - | r-bioc-xvector |
| - | r-bioc-biocgenerics |
| - | r-cran-rcurl |
| - | r-bioc-biobase |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-isoformswitchanalyzer:
sudo apt-get install r-bioc-isoformswitchanalyzer_1.20.0+ds-1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/R/IsoformSwitchAnalyzeR |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/R/IsoformSwitchAnalyzeR.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/R/IsoformSwitchAnalyzeR.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/data/exampleSwitchList.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/data/exampleSwitchListAnalyzed.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/data/exampleSwitchListIntermediary.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/doc/IsoformSwitchAnalyzeR.R |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/doc/IsoformSwitchAnalyzeR.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/Fibroblasts_0/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/Fibroblasts_1/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/cpat_results.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/cpc2_result.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep1/aux_info/meta_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep1/cmd_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep1/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep2/aux_info/meta_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep2/cmd_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond1_rep2/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep1/aux_info/meta_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep1/cmd_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep1/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep2/aux_info/meta_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep2/cmd_info.json |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/drosophila/data_cond2_rep2/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/example.gtf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/example_isoform_nt.fasta.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/hESC_0/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/hESC_1/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/iPS_0/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/iPS_1/quant.sf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/iupred2a_result.txt.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/pfam_results.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/extdata/signalP_results.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/help/IsoformSwitchAnalyzeR.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/help/IsoformSwitchAnalyzeR.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/IsoformSwitchAnalyzeR/libs/IsoformSwitchAnalyzeR.so |
| ./usr/share/doc/r-bioc-isoformswitchanalyzer/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-isoformswitchanalyzer/copyright |