معرفی شرکت ها
python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | python3-pairtools-examples |
| نام فایل بسته | python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.0.2 |
| انتشار بسته | 2+b1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/mirnylab/pairtools |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 495696 |
| حجم نصب | 539 |
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C
experiment.
.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
.
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
sequences of Hi-C DNA molecules
- Sort .pairs files for downstream analyses
- Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
- Generate extensive statistics of Hi-C datasets
- Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
- Restore .sam alignments from Hi-C pairs
.
This package contains some examples
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_arm64.deb | 1.0.2 | arm64 | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_armel.deb | 1.0.2 | armel | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_armhf.deb | 1.0.2 | armhf | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_i386.deb | 1.0.2 | i386 | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_mips64el.deb | 1.0.2 | mips64el | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_mipsel.deb | 1.0.2 | mipsel | Debian main |
| python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_ppc64el.deb | 1.0.2 | ppc64el | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python3-pairtools-examples:
sudo apt-get install python3-pairtools-examples_1.0.2-2+b1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/benchmark/Snakefile.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/benchmark/benchmark.ipynb.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/benchmark/benchmarking_1mln.csv.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/example_pipeline.sh |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/example_singlecell_pipeline.sh |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/pairtools_phase_walkthrough.ipynb.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/pairtools_restrict_walkthrough.ipynb.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/pairtools_walkthrough.ipynb.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/scalings_example.ipynb.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/common_py.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.2.pairsam |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.4dedup.pairsam |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.4filterbycov.pairs |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.4flip.pairs |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.4stats.pairs |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.chrom.sizes |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.pairsam |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.parse-all.sam.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.parse2.sam.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.rsites.bed |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.sam.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/data/mock.test-restr.pairs |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_dedup.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_filterbycov.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_flip.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_header.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_headerops.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_markasdup.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_merge.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_parse.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_parse2.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_restrict.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_scaling.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_select.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_sort.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_split.py |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools/examples/tests/test_stats.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools-examples/changelog.Debian.amd64.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools-examples/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools-examples/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pairtools-examples/copyright |