معرفی شرکت ها

pilon_1.24-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

automated genome assembly improvement and variant detection tool
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته pilon
نام فایل بسته pilon_1.24-2_all.deb
نسخه بسته 1.24
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/broadinstitute/pilon/wiki
مجوز -
حجم دانلود 497060
حجم نصب 613
Pilon is a software tool which can be used to: * Automatically improve draft assemblies * Find variation among strains, including large event detection Pilon requires as input a FASTA file of the genome along with one or more BAM files of reads aligned to the input FASTA file. Pilon uses read alignment analysis to identify inconsistencies between the input genome and the evidence in the reads. It then attempts to make improvements to the input genome, including: * Single base differences * Small indels * Larger indel or block substitution events * Gap filling * Identification of local misassemblies, including optional opening of new gaps


نیازمندی

مقدار نام
- default-jre
- java-wrappers
- libhtsjdk-java
- libcommons-lang-java
- scala-library


نحوه نصب


نصب پکیج deb pilon:

    sudo apt-get install pilon_1.24-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/pilon
./usr/share/doc/pilon/README.md
./usr/share/doc/pilon/README.test
./usr/share/doc/pilon/README.test_data
./usr/share/doc/pilon/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/pilon/copyright
./usr/share/doc/pilon/examples/NC_045512.2.fasta
./usr/share/doc/pilon/examples/README.test_data
./usr/share/doc/pilon/examples/SRR11728627.sorted.bam
./usr/share/doc/pilon/examples/SRR11728627.sorted.bam.bai
./usr/share/doc/pilon/examples/ref/pilon.fasta
./usr/share/doc/pilon/run-unit-test
./usr/share/java/pilon.jar
./usr/share/lintian/overrides/pilon
./usr/share/man/man1/pilon.1.gz