معرفی شرکت ها

picard-tools_2.27.5+dfsg-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Command line tools to manipulate SAM and BAM files
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته picard-tools
نام فایل بسته picard-tools_2.27.5+dfsg-2_all.deb
نسخه بسته 2.27.5+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://broadinstitute.github.io/picard/
مجوز -
حجم دانلود 311096
حجم نصب 329
SAM (Sequence Alignment/Map) format is a generic format for storing large nucleotide sequence alignments. Picard Tools includes these utilities to manipulate SAM and BAM files: AddCommentsToBam FifoBuffer AddOrReplaceReadGroups FilterSamReads BaitDesigner FilterVcf BamIndexStats FixMateInformation GatherBamFiles BedToIntervalList GatherVcfs BuildBamIndex GenotypeConcordance CalculateHsMetrics IlluminaBasecallsToFastq CalculateReadGroupChecksum IlluminaBasecallsToSam CheckIlluminaDirectory LiftOverIntervalList CheckTerminatorBlock LiftoverVcf CleanSam MakeSitesOnlyVcf CollectAlignmentSummaryMetrics MarkDuplicates CollectBaseDistributionByCycle MarkDuplicatesWithMateCigar CollectGcBiasMetrics MarkIlluminaAdapters CollectHiSeqXPfFailMetrics MeanQualityByCycle CollectIlluminaBasecallingMetrics MergeBamAlignment CollectIlluminaLaneMetrics MergeSamFiles CollectInsertSizeMetrics MergeVcfs CollectJumpingLibraryMetrics NormalizeFasta CollectMultipleMetrics PositionBasedDownsampleSam CollectOxoGMetrics QualityScoreDistribution CollectQualityYieldMetrics RenameSampleInVcf CollectRawWgsMetrics ReorderSam CollectRnaSeqMetrics ReplaceSamHeader CollectRrbsMetrics RevertOriginalBaseQualitiesAndAddMateCigar CollectSequencingArtifactMetrics RevertSam CollectTargetedPcrMetrics SamFormatConverter CollectVariantCallingMetrics SamToFastq CollectWgsMetrics ScatterIntervalsByNs CompareMetrics SortSam CompareSAMs SortVcf ConvertSequencingArtifactToOxoG SplitSamByLibrary CreateSequenceDictionary SplitVcfs DownsampleSam UpdateVcfSequenceDictionary EstimateLibraryComplexity ValidateSamFile ExtractIlluminaBarcodes VcfFormatConverter ExtractSequences VcfToIntervalList FastqToSam ViewSam


نیازمندی

مقدار نام
- default-jre | java6-runtime
= 2.27.5+dfsg-2 libpicard-java


نحوه نصب


نصب پکیج deb picard-tools:

    sudo apt-get install picard-tools_2.27.5+dfsg-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/PicardCommandLine
./usr/share/doc/picard-tools/README.test
./usr/share/doc/picard-tools/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/picard-tools/copyright
./usr/share/doc/picard-tools/mini.vcf.gz
./usr/share/doc/picard-tools/mini.vcf.idx
./usr/share/doc/picard-tools/run-unit-test
./usr/share/doc/picard-tools/test.fasta
./usr/share/doc/picard-tools/test.sam
./usr/share/doc/picard-tools/unmapped.sam
./usr/share/man/man1/PicardCommandLine.1.gz
./usr/bin/picard-tools -> PicardCommandLine
./usr/share/debian-med/bin/picard -> ../../../bin/PicardCommandLine
./usr/share/man/man1/picard-tools.1.gz -> PicardCommandLine.1.gz