معرفی شرکت ها

nanosv_1.2.4+git20190409.c1ae30c-6_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

structural variant caller for nanopore data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته nanosv
نام فایل بسته nanosv_1.2.4+git20190409.c1ae30c-6_all.deb
نسخه بسته 1.2.4+git20190409.c1ae30c
انتشار بسته 6
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/mroosmalen/nanosv
مجوز -
حجم دانلود 3043072
حجم نصب 20558
NanoSV is a software package that can be used to identify structural genomic variations in long-read sequencing data, such as data produced by Oxford Nanopore Technologies’ MinION, GridION or PromethION instruments, or Pacific Biosciences RSII or Sequel sequencers. NanoSV has been extensively tested using Oxford Nanopore MinION sequencing data.


نیازمندی

مقدار نام
- python3-pysam
- python3-vcf
- python3:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb nanosv:

    sudo apt-get install nanosv_1.2.4+git20190409.c1ae30c-6_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/NanoSV
./usr/lib/python3/dist-packages/NanoSV-1.2.4.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/NanoSV-1.2.4.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/NanoSV-1.2.4.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/NanoSV-1.2.4.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/NanoSV-1.2.4.egg-info/top_level.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/NanoSV.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/bedfiles/human_hg19.bed
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/breakpoint.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/read.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/segment.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/sv.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/classes/variant.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/config.ini
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/coverage.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/create_vcf.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/parse_bam.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/parse_breakpoints.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/parse_reads.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/parse_svs.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/utils/phasing.py
./usr/lib/python3/dist-packages/nanosv/version.py
./usr/share/doc/nanosv/README.md.gz
./usr/share/doc/nanosv/README.test
./usr/share/doc/nanosv/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/nanosv/copyright
./usr/share/doc/nanosv/run-unit-test
./usr/share/man/man1/NanoSV.1.gz