معرفی شرکت ها
libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | libvcflib-tools |
| نام فایل بسته | libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.0.3+dfsg |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/vcflib/vcflib |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 747840 |
| حجم نصب | 4880 |
The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format
intended to concisely describe reference-indexed variations between
individuals. VCF provides a common interchange format for the description of
variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto
standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.
.
vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it
can be described by VCF. It is both:
.
* an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
be described by the VCF format,
* and a collection of command-line utilities for executing complex
manipulations on VCF files.
.
This package contains several tools using the library.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_arm64.deb | 1.0.3+dfsg | arm64 | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_armel.deb | 1.0.3+dfsg | armel | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_armhf.deb | 1.0.3+dfsg | armhf | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_i386.deb | 1.0.3+dfsg | i386 | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_mips64el.deb | 1.0.3+dfsg | mips64el | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_mipsel.deb | 1.0.3+dfsg | mipsel | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_ppc64el.deb | 1.0.3+dfsg | ppc64el | Debian main |
| libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_s390x.deb | 1.0.3+dfsg | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.34 | libc6 |
| >= 0.0.2 | libdisorder0 |
| >= 0.0+git20160702.bbc645f | libfastahack0 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| >= 0.0+git20160702.2610e25 | libsmithwaterman0 |
| >= 11 | libstdc++6 |
| >= 1.0.0 | libtabixpp0 |
| >= 1.0.3+dfsg | libvcflib1 |
| - | python3:any |
| - | r-base-core |
| - | r-cran-plyr |
| - | r-cran-ggplot2 |
| - | r-cran-gridbase |
نحوه نصب
نصب پکیج deb libvcflib-tools:
sudo apt-get install libvcflib-tools_1.0.3+dfsg-2_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/vcf2tsv |
| ./usr/bin/vcfallelicprimitives |
| ./usr/bin/vcffilter |
| ./usr/bin/vcffixup |
| ./usr/bin/vcfkeepinfo |
| ./usr/bin/vcflib |
| ./usr/bin/vcfuniqalleles |
| ./usr/lib/vcflib/bin/abba-baba |
| ./usr/lib/vcflib/bin/bFst |
| ./usr/lib/vcflib/bin/bed2region |
| ./usr/lib/vcflib/bin/bgziptabix |
| ./usr/lib/vcflib/bin/dumpContigsFromHeader |
| ./usr/lib/vcflib/bin/genotypeSummary |
| ./usr/lib/vcflib/bin/hapLrt |
| ./usr/lib/vcflib/bin/iHS |
| ./usr/lib/vcflib/bin/meltEHH |
| ./usr/lib/vcflib/bin/normalize-iHS |
| ./usr/lib/vcflib/bin/pFst |
| ./usr/lib/vcflib/bin/pVst |
| ./usr/lib/vcflib/bin/permuteGPAT++ |
| ./usr/lib/vcflib/bin/permuteSmooth |
| ./usr/lib/vcflib/bin/plotHaps |
| ./usr/lib/vcflib/bin/popStats |
| ./usr/lib/vcflib/bin/segmentFst |
| ./usr/lib/vcflib/bin/segmentIhs |
| ./usr/lib/vcflib/bin/sequenceDiversity |
| ./usr/lib/vcflib/bin/smoother |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf2bed.py |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf2dag |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf2fasta |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf2sqlite.py |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf2tsv |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcf_strip_extra_headers |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfaddinfo |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfafpath |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfallelicprimitives |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfaltcount |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotate |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotategenotypes |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfbiallelic |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfbreakmulti |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcat |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcheck |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfclassify |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcleancomplex |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfclearid |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfclearinfo |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcombine |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcommonsamples |
| ./usr/lib/vcflib/bin/vcfcomplex |
| ... and 218 more |