معرفی شرکت ها
indelible_1.03-5_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
powerful and flexible simulator of biological evolution
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | indelible |
| نام فایل بسته | indelible_1.03-5_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.03 |
| انتشار بسته | 5 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/indelible/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 419348 |
| حجم نصب | 1463 |
INDELible is a new, portable, and flexible application for biological
sequence simulation that combines many features in the same place for
the first time. Using a length-dependent model of indel formation it
can simulate evolution of multi-partitioned nucleotide, amino-acid,
or codon data sets through the processes of insertion, deletion, and
substitution in continuous time.
.
Nucleotide simulations may use the general unrestricted model or the
general time reversible model and its derivatives, and amino-acid
simulations can be conducted using fifteen different empirical rate
matrices. Substitution rate heterogeneity can be modeled via the
continuous and discrete gamma distributions, with or without a proportion
of invariant sites. INDELible can also simulate under non-homogeneous
and non-stationary conditions where evolutionary models are permitted
to change across a phylogeny.
.
Unique among indel simulation programs, INDELible offers the ability
to simulate using codon models that exhibit nonsynonymous/synonymous
rate ratio heterogeneity among sites and/or lineages.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| indelible_1.03-5_arm64.deb | 1.03 | arm64 | Debian main |
| indelible_1.03-5_armel.deb | 1.03 | armel | Debian main |
| indelible_1.03-5_armhf.deb | 1.03 | armhf | Debian main |
| indelible_1.03-5_i386.deb | 1.03 | i386 | Debian main |
| indelible_1.03-5_mips64el.deb | 1.03 | mips64el | Debian main |
| indelible_1.03-5_mipsel.deb | 1.03 | mipsel | Debian main |
| indelible_1.03-5_ppc64el.deb | 1.03 | ppc64el | Debian main |
| indelible_1.03-5_s390x.deb | 1.03 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.29 | libc6 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| >= 9 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb indelible:
sudo apt-get install indelible_1.03-5_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/indelible |
| ./usr/share/doc/indelible/README.test |
| ./usr/share/doc/indelible/README.test-data |
| ./usr/share/doc/indelible/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/copyright |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/README.test-data |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/J1out.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/J1out_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/J2out.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/J2out_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/Uout.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/Uout_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/WFout.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/WFout_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/Wout.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/Wout_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/aminoacid/userAAmodel.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicaminoacid/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicaminoacid/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicaminoacid/ref/outputname.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicaminoacid/ref/outputname_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicaminoacid/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basiccodon/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basiccodon/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basiccodon/ref/outputname.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basiccodon/ref/outputname_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basiccodon/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicnucleotide/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicnucleotide/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicnucleotide/ref/outputname.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicnucleotide/ref/outputname_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/basicnucleotide/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch/ref/outputname.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch/ref/outputname_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch2/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch2/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch2/ref/outputname.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch2/ref/outputname_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/branch2/ref/trees.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/codon/control.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/codon/ref/LOG.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/codon/ref/out1.fas |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/codon/ref/out1_TRUE.phy |
| ./usr/share/doc/indelible/examples/codon/ref/out2.fas |
| ... and 115 more |