معرفی شرکت ها

gemma_0.98.5+dfsg-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Genome-wide Efficient Mixed Model Association
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته gemma
نام فایل بسته gemma_0.98.5+dfsg-2_amd64.deb
نسخه بسته 0.98.5+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.xzlab.org/software.html
مجوز -
حجم دانلود 406776
حجم نصب 1177
GEMMA is the software implementing the Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm for a standard linear mixed model and some of its close relatives for genome-wide association studies (GWAS): . * It fits a univariate linear mixed model (LMM) for marker association tests with a single phenotype to account for population stratification and sample structure, and for estimating the proportion of variance in phenotypes explained (PVE) by typed genotypes (i.e. "chip heritability"). * It fits a multivariate linear mixed model (mvLMM) for testing marker associations with multiple phenotypes simultaneously while controlling for population stratification, and for estimating genetic correlations among complex phenotypes. * It fits a Bayesian sparse linear mixed model (BSLMM) using Markov chain Monte Carlo (MCMC) for estimating PVE by typed genotypes, predicting phenotypes, and identifying associated markers by jointly modeling all markers while controlling for population structure. * It estimates variance component/chip heritability, and partitions it by different SNP functional categories. In particular, it uses HE regression or REML AI algorithm to estimate variance components when individual-level data are available. It uses MQS to estimate variance components when only summary statisics are available. . GEMMA is computationally efficient for large scale GWAS and uses freely available open-source numerical libraries.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
gemma-doc_0.98.5+dfsg-2_all.deb 0.98.5+dfsg all Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_arm64.deb 0.98.5+dfsg arm64 Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_armhf.deb 0.98.5+dfsg armhf Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_i386.deb 0.98.5+dfsg i386 Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_mips64el.deb 0.98.5+dfsg mips64el Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_ppc64el.deb 0.98.5+dfsg ppc64el Debian main
gemma_0.98.5+dfsg-2_s390x.deb 0.98.5+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.34 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 2.7.1 libgsl27
- libopenblas0
>= 11 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb gemma:

    sudo apt-get install gemma_0.98.5+dfsg-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/gemma
./usr/share/doc/gemma/README.md.gz
./usr/share/doc/gemma/RELEASE-NOTES.md.gz
./usr/share/doc/gemma/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/gemma/copyright