معرفی شرکت ها


barrnap_0.9+dfsg-3_all.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

rapid ribosomal RNA prediction
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته barrnap
نام فایل بسته barrnap_0.9+dfsg-3_all.deb
نسخه بسته 0.9+dfsg
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.vicbioinformatics.com/software.barrnap.shtml
مجوز -
حجم دانلود 204148
حجم نصب 1437
Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) predicts the location of ribosomal RNA genes in genomes. It supports bacteria (5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondria (12S,16S) and eukaryotes (5S,5.8S,28S,18S). . It takes FASTA DNA sequence as input, and writes GFF3 as output. It uses the NHMMER tool that comes with HMMER 3.1 for HMM searching in RNA:DNA style. Multithreading is supported and one can expect roughly linear speed-ups with more CPUs.


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- hmmer
- bedtools


نحوه نصب


نصب پکیج deb barrnap:

    sudo apt-get install barrnap_0.9+dfsg-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/barrnap
./usr/share/barrnap/db/arc.hmm
./usr/share/barrnap/db/bac.hmm
./usr/share/barrnap/db/euk.hmm
./usr/share/barrnap/db/mito.hmm
./usr/share/doc/barrnap/README.md.gz
./usr/share/doc/barrnap/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/barrnap/copyright
./usr/share/man/man1/barrnap.1.gz