معرفی شرکت ها


yanagiba_1.0.0-5_all.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

filter low quality Oxford Nanopore reads basecalled with Albacore
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته yanagiba
نام فایل بسته yanagiba_1.0.0-5_all.deb
نسخه بسته 1.0.0
انتشار بسته 5
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/Adamtaranto/Yanagiba
مجوز -
حجم دانلود 25592
حجم نصب 57
Yanagiba is used to filter short or low quality Oxford Nanopore reads which have been basecalled with Albacore. It takes fastq.gz and an Albacore summary file as input. If no Albacore summary file is provided attempt to calculate mean qscore from directly from fastq file using NanoMath. Note: Calculated quality scores appear to be lower for reads called with Metrichor, you may need to lower your minqual setting in this case.


نیازمندی

مقدار نام
- python3-biopython
- python3-nanomath
- python3-pandas
- python3:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb yanagiba:

    sudo apt-get install yanagiba_1.0.0-5_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/yanagiba
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba/cmd_line.py
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/yanagiba-1.0.0.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/yanagiba/README.md
./usr/share/doc/yanagiba/README.test
./usr/share/doc/yanagiba/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/yanagiba/copyright
./usr/share/doc/yanagiba/examples/data.fastq.gz
./usr/share/doc/yanagiba/get-test-data
./usr/share/doc/yanagiba/run-unit-test
./usr/share/man/man1/yanagiba.1.gz