معرفی شرکت ها

ssake_4.0.1-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

genomics application for assembling millions of very short DNA sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته ssake
نام فایل بسته ssake_4.0.1-1_all.deb
نسخه بسته 4.0.1
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/ssake
مجوز -
حجم دانلود 50068
حجم نصب 214
The Short Sequence Assembly by K-mer search and 3′ read Extension (SSAKE) is a genomics application for aggressively assembling millions of short nucleotide sequences by progressively searching for perfect 3′-most k-mers using a DNA prefix tree. SSAKE is designed to help leverage the information from short sequences reads by stringently clustering them into contigs that can be used to characterize novel sequencing targets.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
ssake-examples_4.0.1-1_all.deb 4.0.1 all Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- python3
- libperl4-corelibs-perl


نحوه نصب


نصب پکیج deb ssake:

    sudo apt-get install ssake_4.0.1-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ssake
./usr/share/doc/ssake/README.Debian
./usr/share/doc/ssake/README.html
./usr/share/doc/ssake/TQS.readme
./usr/share/doc/ssake/TRIMMING_PAIRED_READS.README
./usr/share/doc/ssake/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/ssake/copyright
./usr/share/man/man1/ssake.1.gz
./usr/share/man/man1/tqs.1.gz
./usr/share/ssake/TQS.py
./usr/share/ssake/TQSexport.py
./usr/share/ssake/TQSfastq.pl
./usr/share/ssake/TQSfastq.py
./usr/share/ssake/analyzePositionSSAKE.pl
./usr/share/ssake/getStats.pl
./usr/share/ssake/makeFastaFileFromScaffolds.pl
./usr/share/ssake/makePairedOutput.pl
./usr/share/ssake/makePairedOutput2EQUALfiles.pl
./usr/share/ssake/makePairedOutput2UNEQUALfiles.pl
./usr/share/ssake/nLength.pl
./usr/share/ssake/qseq2fasta.pl
./usr/share/ssake/qseq2fastq.pl
./usr/share/ssake/runSSAKE.sh
./usr/share/ssake/splitInput.pl
./usr/bin/tqs -> ../share/ssake/TQS.py