معرفی شرکت ها

snpeff_5.1+d+dfsg-3_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

genetic variant annotation and effect prediction toolbox - tool
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته snpeff
نام فایل بسته snpeff_5.1+d+dfsg-3_all.deb
نسخه بسته 5.1+d+dfsg
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://pcingola.github.io/SnpEff/
مجوز -
حجم دانلود 6940
حجم نصب 21
"We are all different!" Geneticists agree to this. Even twins, who are said to be identical are on a molecular level only "mostly" identical. And even within the exact same individual, healthy cells acquire mutations such that we are all genetic mosaics. Changes to individual cells may be induced by environmental factors, e.g. like UV light, or happen sporadically as mishaps during cellular divisions. . Because there are so many genetic differences, and most have just no particular meaning for the development of a phenotype, i.e. most have no effect, it would be nice to have heuristics implemented that direct the researcher towards single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that are most likely to be relevant. This identifies the gene that causes or contributes to, e.g, an illness, and possibly also genes that are affected by that change. Such mechanistic understanding of a disease, particularly when multiple genes and multiple genetic variants are contributing to the then "polygenic" phenotype, is at the onset of drug development and increasingly also for selecting individualized therapies in the clinic. . SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes (such as amino acid changes). The inputs are predicted variants (SNPs, insertions, deletions and MNPs). The input file is usually obtained as a result of a sequencing experiment, and it is usually in variant call format (VCF). . SnpEff analyzes the input variants. It annotates the variants and calculates the effects they produce on known genes (e.g. amino acid changes). . This package contains the command line tool.


نیازمندی

مقدار نام
- default-jre
= 5.1+d+dfsg-3 libsnpeff-java


نحوه نصب


نصب پکیج deb snpeff:

    sudo apt-get install snpeff_5.1+d+dfsg-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/snpEff
./usr/share/doc/snpeff/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/snpeff/copyright
./usr/share/lintian/overrides/snpeff
./usr/share/man/man1/snpEff.1.gz