معرفی شرکت ها

rockhopper_2.0.3+dfsg2-3_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

system for analyzing bacterial RNA-seq data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته rockhopper
نام فایل بسته rockhopper_2.0.3+dfsg2-3_all.deb
نسخه بسته 2.0.3+dfsg2
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://cs.wellesley.edu/~btjaden/Rockhopper/
مجوز -
حجم دانلود 596648
حجم نصب 650
Rockhopper is a comprehensive and user-friendly system for computational analysis of bacterial RNA-seq data. As input, Rockhopper takes RNA sequencing reads output by high-throughput sequencing technology (FASTQ, QSEQ, FASTA, SAM, or BAM files). Rockhopper supports the following tasks: . * Reference based transcript assembly (when one or more reference genomes are available) - Aligning reads to genomes - Assembling transcripts - Identifying transcript boundaries and novel transcripts such as small RNAs * De novo transcript assembly (when reference genomes are unavailable) * Normalizing data from different experiments * Quantifying transcript abundance * Testing for differential gene expression * Characterizing operon structures * Visualizing results in a genome browser


نیازمندی

مقدار نام
- igv
- default-jre


نحوه نصب


نصب پکیج deb rockhopper:

    sudo apt-get install rockhopper_2.0.3+dfsg2-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/rockhopper
./usr/bin/rockhoppergui
./usr/share/applications/rockhoppergui.desktop
./usr/share/doc/rockhopper/README.Debian
./usr/share/doc/rockhopper/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/rockhopper/copyright
./usr/share/icons/hicolor/64x64/apps/rockhopper.png
./usr/share/java/rockhopper-2.0.3.jar
./usr/share/man/man1/rockhopper.1.gz
./usr/share/man/man1/rockhoppergui.1.gz
./usr/share/metainfo/edu.wellesley.cs.rockhoppergui.metainfo.xml
./usr/share/java/rockhopper.jar -> rockhopper-2.0.3.jar