معرفی شرکت ها
r-bioc-tcgabiolinks_2.25.3+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
GNU R/Bioconductor package for integrative analysis with GDC data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | r-bioc-tcgabiolinks |
| نام فایل بسته | r-bioc-tcgabiolinks_2.25.3+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 2.25.3+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/TCGAbiolinks/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 6506912 |
| حجم نصب | 6791 |
The aim of TCGAbiolinks is:
1) facilitate the GDC open-access data retrieval,
2) prepare the data using the appropriate pre-processing strategies,
3) provide the means to carry out different standard analyses and
4) to easily reproduce earlier research results.
In more detail, the package provides multiple methods for analysis (e.g.,
differential expression analysis, identifying differentially methylated
regions) and methods for visualization (e.g., survival plots, volcano plots,
starburst plots) in order to easily develop complete analysis pipelines.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-tcgabiolinksgui.data_1.18.0+dfsg-1_all.deb | 1.18.0+dfsg | all | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| >= 0.4 | r-cran-downloader |
| - | r-bioc-biomart |
| - | r-cran-dplyr |
| - | r-cran-tibble |
| - | r-bioc-genomicranges |
| >= 3.98.0 | r-cran-xml |
| - | r-cran-data.table |
| >= 1.0.0 | r-cran-jsonlite |
| - | r-cran-plyr |
| - | r-cran-knitr |
| - | r-cran-ggplot2 |
| >= 1.0.0 | r-cran-stringr |
| - | r-bioc-iranges |
| >= 0.3.0 | r-cran-rvest |
| - | r-bioc-s4vectors |
| - | r-cran-r.utils |
| >= 1.4.0 | r-bioc-summarizedexperiment |
| >= 1.15.1 | r-bioc-tcgabiolinksgui.data |
| - | r-cran-readr |
| - | r-cran-tidyr |
| - | r-cran-purrr |
| - | r-cran-xml2 |
| >= 1.2.1 | r-cran-httr |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-tcgabiolinks:
sudo apt-get install r-bioc-tcgabiolinks_2.25.3+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/R/TCGAbiolinks |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/R/TCGAbiolinks.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/R/TCGAbiolinks.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/R/sysdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/R/sysdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/data/Rdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/data/Rdata.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/data/Rdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/data/datalist |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/analysis.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/analysis.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/casestudy.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/casestudy.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/classifiers.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/classifiers.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/clinical.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/clinical.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/download_prepare.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/download_prepare.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/extension.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/extension.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/gui.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/gui.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/index.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/index.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/mutation.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/mutation.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/query.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/query.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/stemness_score.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/stemness_score.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/subtypes.R |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/doc/subtypes.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/help/TCGAbiolinks.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/help/TCGAbiolinks.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/TCGAbiolinks/html/R.css |
| ./usr/share/doc/r-bioc-tcgabiolinks/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-tcgabiolinks/copyright |