معرفی شرکت ها

r-bioc-ioniser_2.22.0+dfsg-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Quality Assessment Tools for Oxford Nanopore MinION data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته r-bioc-ioniser
نام فایل بسته r-bioc-ioniser_2.22.0+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 2.22.0+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/IONiseR/
مجوز -
حجم دانلود 1129328
حجم نصب 2101
IONiseR provides tools for the quality assessment of Oxford Nanopore MinION data. It extracts summary statistics from a set of fast5 files and can be used either before or after base calling. In addition to standard summaries of the read-types produced, it provides a number of plots for visualising metrics relative to experiment run time or spatially over the surface of a flowcell.


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.2.2.20221110-1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-api-bioc-3.16
- r-bioc-rhdf5
- r-cran-dplyr
- r-cran-magrittr
- r-cran-tidyr
- r-bioc-shortread
- r-bioc-biostrings
- r-cran-ggplot2
- r-bioc-biocgenerics
- r-bioc-xvector
- r-cran-tibble
- r-bioc-biocparallel
- r-cran-bit64
- r-cran-stringr


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-ioniser:

    sudo apt-get install r-bioc-ioniser_2.22.0+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/INDEX
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/NEWS
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/R/IONiseR
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/R/IONiseR.rdb
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/R/IONiseR.rdx
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/doc/IONiseR.R
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/doc/IONiseR.Rmd
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/doc/IONiseR.html
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/extdata/example.fast5
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/extdata/example_not-working.fast5
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/extdata/example_v2.fast5
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/help/IONiseR.rdb
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/help/IONiseR.rdx
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/IONiseR/html/R.css
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/copyright
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/run-unit-test
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/tests/testthat/test_Fast5Summary.R
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/tests/testthat/test_fastq.R
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/tests/testthat/test_plotting.R
./usr/share/doc/r-bioc-ioniser/tests/testthat.R