معرفی شرکت ها
r-bioc-gviz_1.42.1+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Plotting data and annotation information along genomic coordinates
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | r-bioc-gviz |
| نام فایل بسته | r-bioc-gviz_1.42.1+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.42.1+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/Gviz/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 5145072 |
| حجم نصب | 6970 |
Genomic data analyses requires integrated visualization of known
genomic information and new experimental data. Gviz uses the biomaRt and
the rtracklayer packages to perform live annotation queries to Ensembl
and UCSC and translates this to e.g. gene/transcript structures in
viewports of the grid graphics package. This results in genomic
information plotted together with your data.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-2 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| >= 0.9.25 | r-bioc-s4vectors |
| >= 1.99.18 | r-bioc-iranges |
| >= 1.17.20 | r-bioc-genomicranges |
| >= 0.5.7 | r-bioc-xvector |
| >= 1.25.13 | r-bioc-rtracklayer |
| - | r-cran-lattice |
| - | r-cran-rcolorbrewer |
| >= 2.11.0 | r-bioc-biomart |
| >= 1.27.5 | r-bioc-annotationdbi |
| >= 2.15.3 | r-bioc-biobase |
| >= 1.17.22 | r-bioc-genomicfeatures |
| >= 2.11.3 | r-bioc-ensembldb |
| >= 1.33.1 | r-bioc-bsgenome |
| >= 2.33.11 | r-bioc-biostrings |
| >= 1.13.8 | r-bioc-biovizbase |
| >= 1.17.28 | r-bioc-rsamtools |
| >= 0.6-26 | r-cran-latticeextra |
| >= 0.8.14 | r-cran-matrixstats |
| >= 1.1.16 | r-bioc-genomicalignments |
| >= 1.1.3 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 0.11.3 | r-bioc-biocgenerics |
| >= 0.6.8 | r-cran-digest |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-gviz:
sudo apt-get install r-bioc-gviz_1.42.1+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/R/Gviz |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/R/Gviz.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/R/Gviz.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/alTrackGenes.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/biomTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/biomTrack2.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/bmTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/collapseTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/cpgIslands.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/cyp2b10.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/denseAnnTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/dtHoriz.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/geneDetails.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/geneModels.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/idTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/ideoTrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/itrack.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/twoGroups.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/data/ucscItems.rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/doc/Gviz.R |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/doc/Gviz.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/GSM461176_S2_DRSC_Untreated_1_bmm.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/GSM461176_S2_DRSC_Untreated_1_bmm.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/GSM461179_S2_DRSC_CG8144_RNAi_1_bmm.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/GSM461179_S2_DRSC_CG8144_RNAi_1_bmm.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/biomartVersionsLatest.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/biomartVersionsNow.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/gapped.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/gapped.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/indels.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/indels.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/snps.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/snps.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/test.2bit |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/test.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Gviz/extdata/test.bam.bai |
| ... and 30 more |