معرفی شرکت ها
r-bioc-genomicfeatures_1.50.4+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | r-bioc-genomicfeatures |
| نام فایل بسته | r-bioc-genomicfeatures_1.50.4+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.50.4+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/GenomicFeatures/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1675836 |
| حجم نصب | 4552 |
A set of tools and methods for making and manipulating transcript
centric annotations. With these tools the user can easily download the
genomic locations of the transcripts, exons and cds of a given organism,
from either the UCSC Genome Browser or a BioMart database (more sources
will be supported in the future). This information is then stored in a
local database that keeps track of the relationship between transcripts,
exons, cds and genes. Flexible methods are provided for extracting the
desired features in a convenient format.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-2 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| >= 0.1.0 | r-bioc-biocgenerics |
| >= 0.17.29 | r-bioc-s4vectors |
| >= 2.13.23 | r-bioc-iranges |
| >= 1.34.7 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.31.17 | r-bioc-genomicranges |
| >= 1.41.4 | r-bioc-annotationdbi |
| - | r-cran-dbi |
| >= 2.0 | r-cran-rsqlite |
| - | r-cran-rcurl |
| >= 0.19.7 | r-bioc-xvector |
| >= 2.47.6 | r-bioc-biostrings |
| - | r-bioc-biocio |
| >= 1.51.5 | r-bioc-rtracklayer |
| >= 2.17.1 | r-bioc-biomart |
| >= 2.15.1 | r-bioc-biobase |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-genomicfeatures:
sudo apt-get install r-bioc-genomicfeatures_1.50.4+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/GenomicFeatures |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/GenomicFeatures.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/GenomicFeatures.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.html |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.md |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/Biomart_Ensembl_sample.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/FeatureDb.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/NC_011025.gff |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/TheCanonicalGene_v1.gff3 |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/TheCanonicalGene_v2.gff3 |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/a.gff3 |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/a.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/dmel-1000-r5.11.filtered.gff |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GFF3_files/dmel-1000-r5.11.filtered.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GTF_files/Aedes_aegypti.partial.gtf |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GTF_files/Aedes_aegypti.partial.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/GTF_files/test1.gtf |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/hg19_knownGene_sample.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/sacCer2_sgdGene_txdb.sqlite |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/sample_ranges.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/help/GenomicFeatures.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/help/GenomicFeatures.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/script/makeTxDbs.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/script/maketRNAFDb.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/txdb-template/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/txdb-template/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/txdb-template/R/zzz.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/txdb-template/man/package.Rd |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/unitTests/test_TxDb_seqinfo.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/unitTests/test_coordinate-mapping-methods.R |
| ... and 17 more |