معرفی شرکت ها

r-bioc-dexseq_1.44.0+dfsg-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته r-bioc-dexseq
نام فایل بسته r-bioc-dexseq_1.44.0+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 1.44.0+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/DEXSeq/
مجوز -
حجم دانلود 454740
حجم نصب 675
The package is focused on finding differential exon usage using RNA-seq exon counts between samples with different experimental designs. It provides functions that allows the user to make the necessary statistical tests based on a model that uses the negative binomial distribution to estimate the variance between biological replicates and generalized linear models for testing. The package also provides functions for the visualization and exploration of the results.


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.2.2.20221110-1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-api-bioc-3.16
- r-bioc-biocparallel
- r-bioc-biobase
- r-bioc-summarizedexperiment
>= 2.5.17 r-bioc-iranges
>= 1.23.7 r-bioc-genomicranges
>= 1.9.11 r-bioc-deseq2
- r-bioc-annotationdbi
- r-cran-rcolorbrewer
>= 0.23.18 r-bioc-s4vectors
- r-bioc-biocgenerics
- r-bioc-biomart
- r-cran-hwriter
- r-cran-stringr
- r-bioc-rsamtools
- r-cran-statmod
- r-bioc-geneplotter
- r-bioc-genefilter


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-dexseq:

    sudo apt-get install r-bioc-dexseq_1.44.0+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/CITATION
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/INDEX
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/NEWS
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/R/DEXSeq
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/R/DEXSeq.rdb
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/R/DEXSeq.rdx
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/doc/DEXSeq.R
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/doc/DEXSeq.Rmd
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/help/DEXSeq.rdb
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/help/DEXSeq.rdx
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/python_scripts/dexseq_count.py
./usr/lib/R/site-library/DEXSeq/python_scripts/dexseq_prepare_annotation.py
./usr/share/doc/r-bioc-dexseq/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-bioc-dexseq/copyright