معرفی شرکت ها
r-bioc-decoupler_2.4.0+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
infer biological activities from omics data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | r-bioc-decoupler |
| نام فایل بسته | r-bioc-decoupler_2.4.0+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 2.4.0+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/decoupleR/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 2104160 |
| حجم نصب | 2216 |
Many methods allow one to extract biological activities from omics
data using information from prior knowledge resources, reducing the
dimensionality for increased statistical power and better interpretability.
DecoupleR is a Bioconductor package containing different
statistical methods to extract these signatures within a unified framework.
decoupleR allows the user to flexibly test any method with any resource.
It incorporates methods that take into account the sign and weight of
network interactions. decoupleR can be used with any omic, as long as its
features can be linked to a biological process based on prior knowledge.
For example, in transcriptomics gene sets regulated by a transcription
factor, or in phospho-proteomics phosphosites that are targeted by a kinase.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| - | r-cran-broom |
| - | r-cran-dplyr |
| - | r-cran-magrittr |
| - | r-cran-matrix |
| - | r-cran-purrr |
| - | r-cran-rlang |
| - | r-cran-stringr |
| - | r-cran-tibble |
| - | r-cran-tidyr |
| - | r-cran-tidyselect |
| - | r-cran-withr |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-decoupler:
sudo apt-get install r-bioc-decoupler_2.4.0+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/NEWS.md |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/R/decoupleR |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/R/decoupleR.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/R/decoupleR.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/decoupleR.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/decoupleR.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/pw_bk.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/pw_bk.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/pw_sc.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/pw_sc.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/tf_bk.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/tf_bk.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/tf_sc.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/doc/tf_sc.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/extdata/bk_data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/extdata/sc_data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/figures/graphical_abstract.png |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/figures/logo.svg |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/figures/net_plot.png |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/decoupleR.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/decoupleR.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/figures/logo.svg |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/README.md |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/generate_expected_output.R |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/inputs/mat.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/inputs/net.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/aucell/output-aucell.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/decouple/output-decouple.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/fgsea/output-fgsea.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/gsva/output-gsva.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/mdt/output-mdt.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/mlm/output-mlm.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/ora/output-ora.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/udt/output-udt.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/ulm/output-ulm.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/viper/output-viper.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/wmean/output-wmean.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/decoupleR/testdata/outputs/wsum/output-wsum.rds |
| ./usr/share/doc/r-bioc-decoupler/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-decoupler/copyright |