معرفی شرکت ها
qcat_1.1.0-6_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | qcat |
| نام فایل بسته | qcat_1.1.0-6_all.deb |
| نسخه بسته | 1.1.0 |
| انتشار بسته | 6 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/nanoporetech/qcat |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 31204 |
| حجم نصب | 269 |
Qcat is a command-line tool for demultiplexing Oxford Nanopore reads
from FASTQ files. It accepts basecalled FASTQ files and splits the reads
into separate FASTQ files based on their barcode. Qcat makes the
demultiplexing algorithms used in albacore/guppy and EPI2ME available to
be used locally with FASTQ files. Currently qcat implements the EPI2ME
algorithm.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| qcat-examples_1.1.0-6_all.deb | 1.1.0 | all | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3-biopython |
| - | python3-parasail |
| - | python3-six |
| - | python3-yaml |
| - | python3:any |
نحوه نصب
نصب پکیج deb qcat:
sudo apt-get install qcat_1.1.0-6_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/qcat |
| ./usr/bin/qcat-eval |
| ./usr/bin/qcat-eval-truth |
| ./usr/bin/qcat-roc |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/adapters.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/calibration.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/cli.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/config.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/eval.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/eval_full.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/eval_roc.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/layout.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/DUAL_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/DUAL_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD104_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD104_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD104_NBD114_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD104_NBD114_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD114_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/NBD114_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBC001_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBC001_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBC096_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBC096_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBK004_LWB001_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/PBK004_LWB001_5p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB201_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB201_5p_a.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB201_5p_c.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB204_RAB214_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB204_RAB214_5p_a.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB204_RAB214_5p_c.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB214_3p.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB214_5p_a.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RAB214_5p_c.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RBK001.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RBK004.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/RPB004_RLB001.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/VMK001.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/simple_extended.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/resources/kits/simple_standard.yml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_base.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_brill.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_dual.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_epi2me.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_guppy.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/scanner_simple.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/qcat/utils.py |
| ... and 13 more |