معرفی شرکت ها
q2-quality-control_2022.11.1-2_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
QIIME 2 plugin for quality assurance of feature and sequence data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | q2-quality-control |
| نام فایل بسته | q2-quality-control_2022.11.1-2_all.deb |
| نسخه بسته | 2022.11.1 |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://qiime2.org/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 248220 |
| حجم نصب | 458 |
QIIME 2 is a powerful, extensible, and decentralized microbiome analysis
package with a focus on data and analysis transparency. QIIME 2 enables
researchers to start an analysis with raw DNA sequence data and finish with
publication-quality figures and statistical results.
Key features:
* Integrated and automatic tracking of data provenance
* Semantic type system
* Plugin system for extending microbiome analysis functionality
* Support for multiple types of user interfaces (e.g. API, command line,
graphical)
.
QIIME 2 is a complete redesign and rewrite of the QIIME 1 microbiome analysis
pipeline. QIIME 2 will address many of the limitations of QIIME 1, while
retaining the features that makes QIIME 1 a powerful and widely-used analysis
pipeline.
.
QIIME 2 currently supports an initial end-to-end microbiome analysis pipeline.
New functionality will regularly become available through QIIME 2 plugins. You
can view a list of plugins that are currently available on the QIIME 2 plugin
availability page. The future plugins page lists plugins that are being
developed.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3:any |
| - | python3-biom-format |
| - | python3-h5py |
| - | python3-seaborn |
| - | python3-numpy |
| - | python3-pandas |
| - | python3-scipy |
| >= 2022.11.1 | qiime |
| >= 2022.11.1 | q2templates |
| >= 2022.11.1 | q2-taxa |
| - | bowtie2 |
| - | ncbi-blast+ |
| - | samtools |
| - | vsearch |
نحوه نصب
نصب پکیج deb q2-quality-control:
sudo apt-get install q2-quality-control_2022.11.1-2_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_blast.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_evaluate_seqs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_evaluate_taxonomy.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_filter.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_utilities.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/_version.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/assets/index.html |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/citations.bib |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/plugin_setup.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/quality_control.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/bacterial-query-sequences.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/bacterial-ref-sequences.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/exp-results.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/fungal-query-sequences.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/fungal-ref-sequences.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/mock-3-expected-taxonomy.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/mock-3-obs-table.biom |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/mock-3-observed-taxonomy.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/mock-3-results.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/paired-end.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/qc-mock-3-expected.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/qc-mock-3-observed.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/query-partially-random.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/query-sequences-left-justified.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/query-sequences-short.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/query-sequences-with-mismatch.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/query-sequences.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/sars2-genome.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/sars2-indexed.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/single-end.qza |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/test_evaluate_seqs_identical.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/test_evaluate_seqs_mismatches.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/data/test_evaluate_seqs_part_rand.tsv |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/test_filter.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control/tests/test_quality_control.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control-2022.11.1.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control-2022.11.1.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control-2022.11.1.egg-info/entry_points.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control-2022.11.1.egg-info/not-zip-safe |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/q2_quality_control-2022.11.1.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/q2-quality-control/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/q2-quality-control/copyright |