معرفی شرکت ها
python3-pdb2pqr_3.5.2+dfsg-3_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Preparation of protein structures for electrostatics calculations
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | python3-pdb2pqr |
| نام فایل بسته | python3-pdb2pqr_3.5.2+dfsg-3_all.deb |
| نسخه بسته | 3.5.2+dfsg |
| انتشار بسته | 3 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://www.poissonboltzmann.org |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 135524 |
| حجم نصب | 1142 |
PDB2PQR is a Python software package that automates many of the common
tasks of preparing structures for continuum electrostatics calculations.
It thus provides a platform-independent utility for converting protein files
in PDB format to PQR format. These tasks include:
* Adding a limited number of missing heavy atoms to biomolecular structures
* Determining side-chain pKas
* Placing missing hydrogens
* Optimizing the protein for favorable hydrogen bonding
* Assigning charge and radius parameters from a variety of force fields
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3-docutils |
| - | python3-numpy |
| - | python3-pdbx |
| - | python3-propka |
| - | python3-requests |
| - | python3:any |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python3-pdb2pqr:
sudo apt-get install python3-pdb2pqr_3.5.2+dfsg-3_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/__main__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/_version.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/aa.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/biomolecule.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/cells.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/cif.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/config.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/AA.xml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/AMBER.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/AMBER.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/CHARMM.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/CHARMM.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/HYDROGENS.xml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/NA.xml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/PARSE.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/PARSE.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/PATCHES.xml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/PEOEPB.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/PEOEPB.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/SWANSON.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/SWANSON.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/TOPOLOGY.xml |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/TYL06.DAT |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/dat/TYL06.names |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/debump.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/definitions.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/forcefield.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/hydrogens/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/hydrogens/optimize.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/hydrogens/structures.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/inputgen.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/io.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/ligand/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/ligand/mol2.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/ligand/peoe.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/ligand/topology.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/main.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/na.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/pdb.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/psize.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/quatfit.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/residue.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/run.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/structures.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/topology.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr/utilities.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr-3.5.2.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr-3.5.2.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr-3.5.2.egg-info/entry_points.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr-3.5.2.egg-info/requires.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pdb2pqr-3.5.2.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/python3-pdb2pqr/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pdb2pqr/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/python3-pdb2pqr/copyright |