معرفی شرکت ها
python-pyvcf-examples_0.6.8+git20170215.476169c-9_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Example data for Variant Call Format (VCF) parser for Python
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | python-pyvcf-examples |
| نام فایل بسته | python-pyvcf-examples_0.6.8+git20170215.476169c-9_all.deb |
| نسخه بسته | 0.6.8+git20170215.476169c |
| انتشار بسته | 9 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/jamescasbon/PyVCF |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 944872 |
| حجم نصب | 985 |
The Variant Call Format (VCF) specifies the format of a text file used
in bioinformatics for storing gene sequence variations. The format has
been developed with the advent of large-scale genotyping and DNA
sequencing projects, such as the 1000 Genomes Project.
.
The intent of this module is to mimic the ``csv`` module in the Python
stdlib, as opposed to more flexible serialization formats like JSON or
YAML. ``vcf`` will attempt to parse the content of each record based on
the data types specified in the meta-information lines -- specifically
the ##INFO and
##FORMAT lines. If these lines are missing or incomplete, it will check
against the reserved types mentioned in the spec. Failing that, it will
just return strings.
.
This package provides example data to test the Python modules.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python-pyvcf-examples:
sudo apt-get install python-pyvcf-examples_0.6.8+git20170215.476169c-9_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/python-pyvcf-examples/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/python-pyvcf-examples/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/python-pyvcf-examples/copyright |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/1kg.sites.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/1kg.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/FT.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/__init__.py |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/bad-info-character.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/bcftools.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/contig_idonly.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.0.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.1-bnd.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.1-info-multiple-values.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.1-ploidy.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.1-sv.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.1.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/example-4.2.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/freebayes.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/gatk.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/gatk_26_meta.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/gonl.chr20.release4.gtc.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/info-type-character.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-140-file1.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-140-file2.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-140-file3.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-16.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-201.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-201.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-214.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue-254.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/issue_49.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/metadata-whitespace.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/mixed-filtering.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/null_genotype_mono.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/parse-meta-line.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/prof.py |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/samples-space.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/samtools.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/strelka.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/string_as_flag.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/tb.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/tb.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/test_vcf.py.gz |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/uncalled_genotypes.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/walk_left.vcf |
| ./usr/share/doc/python3-vcf/test/walk_refcall.vcf |
| ./usr/share/lintian/overrides/python-pyvcf-examples |