معرفی شرکت ها
plip_2.2.2+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
fully automated protein-ligand interaction profiler
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | plip |
| نام فایل بسته | plip_2.2.2+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 2.2.2+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://projects.biotec.tu-dresden.de/plip-web/plip/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 84320 |
| حجم نصب | 383 |
The Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP) is a tool to analyze
and visualize protein-ligand interactions in PDB files.
.
Features include:
* Detection of eight different types of noncovalent interactions
* Automatic detection of relevant ligands in a PDB file
* Direct download of PDB structures from wwPDB server if valid
PDB ID is given
* Processing of custom PDB files containing protein-ligand complexes
(e.g. from docking)
* No need for special preparation of a PDB file, works out of the box
* Atom-level interaction reports in rST and XML formats for easy parsing
* Generation of PyMOL session files (.pse) for each pairing, enabling easy
preparation of images for publications and talks
* Rendering of preview image for each ligand and its interactions
with the protein
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3-openbabel |
| - | python3-lxml |
| - | python3-numpy |
| - | python3:any |
نحوه نصب
نصب پکیج deb plip:
sudo apt-get install plip_2.2.2+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/plipcmd |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/config.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/logger.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/parallel.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/remote.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/basic/supplemental.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/exchange/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/exchange/json.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/exchange/report.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/exchange/webservices.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/exchange/xml.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/plipcmd.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/structure/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/structure/detection.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/structure/preparation.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_basic_functions.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_command_line.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_hydrogen_bonds.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_intra.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_literature_validated.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_metal_coordination.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_pi_stacking.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_remote_services.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_structure_processing.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_visualization.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_water_bridges.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_xml_parser.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/test/test_xml_writer.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/visualization/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/visualization/chimera.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/visualization/pymol.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip/visualization/visualize.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/entry_points.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/not-zip-safe |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/requires.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/plip-2.2.2.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/plip/DOCUMENTATION.md.gz |
| ./usr/share/doc/plip/README.md.gz |
| ./usr/share/doc/plip/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/plip/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/plip/copyright |
| ./usr/share/man/man1/plipcmd.1.gz |