معرفی شرکت ها

libsnpeff-java_5.1+d+dfsg-3_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

genetic variant annotation and effect prediction toolbox - lib
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته libsnpeff-java
نام فایل بسته libsnpeff-java_5.1+d+dfsg-3_all.deb
نسخه بسته 5.1+d+dfsg
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://pcingola.github.io/SnpEff/
مجوز -
حجم دانلود 2149936
حجم نصب 19874
SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes (such as amino acid changes). . The inputs are predicted variants (SNPs, insertions, deletions and MNPs). The input file is usually obtained as a result of a sequencing experiment, and it is usually in variant call format (VCF). . SnpEff analyzes the input variants. It annotates the variants and calculates the effects they produce on known genes (e.g. amino acid changes). . This package contains the library.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
libsnpeff-java-doc_5.1+d+dfsg-3_all.deb 5.1+d+dfsg all Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- junit5
>= 1.10.1 libapfloat-java
- libbiojava6-java
>= 1.3 libcharts4j-java
>= 1.5.0 libcommons-cli-java
>= 1.15 libcommons-codec-java
>= 2.11.0 libcommons-io-java
>= 3.6.1 libcommons-math3-java
>= 1.0 libdistlib-java
- libfreemarker-java
- libtrove3-java
- libhtsjdk-java


نحوه نصب


نصب پکیج deb libsnpeff-java:

    sudo apt-get install libsnpeff-java_5.1+d+dfsg-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./etc/snpeff/snpEff.config
./usr/share/doc/libsnpeff-java/README.Debian
./usr/share/doc/libsnpeff-java/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/libsnpeff-java/copyright
./usr/share/java/snpeff.jar
./usr/share/lintian/overrides/libsnpeff-java
./usr/share/maven-repo/org/snpeff/snpeff/5.1/snpeff-5.1.pom
./usr/share/maven-repo/org/snpeff/snpeff/debian/snpeff-debian.pom
./usr/share/java/snpeff-5.1.jar -> snpeff.jar
./usr/share/maven-repo/org/snpeff/snpeff/5.1/snpeff-5.1.jar -> ../../../../../java/snpeff.jar
./usr/share/maven-repo/org/snpeff/snpeff/debian/snpeff-debian.jar -> ../../../../../java/snpeff.jar