معرفی شرکت ها

idseq-bench_0.0~git20210602.27fb6dc-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Benchmark generator for the IDseq Portal
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته idseq-bench
نام فایل بسته idseq-bench_0.0~git20210602.27fb6dc-1_all.deb
نسخه بسته 0.0~git20210602.27fb6dc
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/chanzuckerberg/idseq-bench
مجوز -
حجم دانلود 23868
حجم نصب 94
IDseq (Infectious Disease Sequencing Platform) is an unbiased global software platform that helps scientists identify pathogens in metagenomic sequencing data. . * Discover - Identify the pathogen landscape * Detect - Monitor and review potential outbreaks * Decipher - Find potential infecting organisms in large datasets . This package provides the benchmark generator for the IDseq Portal.


نیازمندی

مقدار نام
- insilicoseq
- ncbi-acc-download
- python3-numpy
- python3-sklearn
- python3-smart-open
- python3:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb idseq-bench:

    sudo apt-get install idseq-bench_0.0~git20210602.27fb6dc-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/idseq-bench-compare
./usr/bin/idseq-bench-generate
./usr/bin/idseq-bench-score
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/compare.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/generate.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/genome.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/parsers.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/score.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/scoring/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/scoring/idseq.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/scoring/metrics.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/scoring/truth.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench/util.py
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench-0.2.6.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench-0.2.6.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench-0.2.6.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench-0.2.6.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/idseq_bench-0.2.6.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/idseq-bench/README.Debian
./usr/share/doc/idseq-bench/README.md.gz
./usr/share/doc/idseq-bench/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/idseq-bench/copyright
./usr/share/doc/idseq-bench/examples/mutated_rhinovirus_c.yaml
./usr/share/doc/idseq-bench/examples/top_6_genomes.yaml
./usr/share/man/man1/idseq-bench-generate.1.gz
./usr/share/man/man1/idseq-bench-score.1.gz