معرفی شرکت ها

chip-seq-data_1.5.5-3_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

tools performing common ChIP-Seq data analysis tasks (data)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته chip-seq-data
نام فایل بسته chip-seq-data_1.5.5-3_all.deb
نسخه بسته 1.5.5
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://ccg.epfl.ch//chipseq
مجوز -
حجم دانلود 3003644
حجم نصب 20237
The ChIP-Seq software provides a set of tools performing common genome- wide ChIP- seq analysis tasks, including positional correlation analysis, peak detection, and genome partitioning into signal-rich and signal-poor regions. These tools exist as stand-alone C programs and perform the following tasks: . 1. Positional correlation analysis and generation of an aggregation plot (AP) (chipcor), 2. Extraction of specific genome annotation features around reference anchor points (chipextract), 3. Read centering or shifting (chipcenter), 4. Narrow peak caller using a fixed width peak size (chippeak), 5. Broad peak caller used for large regions of enrichment (chippart), 6. Feature selection tool based on a read count threshold (chipscore). . Because the ChIP-Seq tools are primarily optimized for speed, they use their own compact format for ChIP-seq data representation called SGA (Simplified Genome Annotation). SGA is a line-oriented, tab-delimited plain text format. . This package contains the database files shipped with chip-seq.


نیازمندی

مقدار نام
-


نحوه نصب


نصب پکیج deb chip-seq-data:

    sudo apt-get install chip-seq-data_1.5.5-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/chip-seq/chr_NC_gi
./usr/share/chip-seq/chr_size
./usr/share/chip-seq/chro_idx.nstorage
./usr/share/doc/chip-seq-data/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/chip-seq-data/copyright