معرفی شرکت ها
bio-vcf_0.9.5-3_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
domain specific language (DSL) for processing the VCF format
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | bio-vcf |
| نام فایل بسته | bio-vcf_0.9.5-3_all.deb |
| نسخه بسته | 0.9.5 |
| انتشار بسته | 3 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/vcflib/bio-vcf |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 28792 |
| حجم نصب | 141 |
Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the
VCF format. Record named fields can be queried with regular
expressions, e.g.
.
sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4
.
Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf
is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a
really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can
output any type of textual data, including VCF header and contents in
RDF and JSON.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | ruby |
نحوه نصب
نصب پکیج deb bio-vcf:
sudo apt-get install bio-vcf_0.9.5-3_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/bio-vcf |
| ./usr/share/doc/bio-vcf/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/bio-vcf/copyright |
| ./usr/share/man/man1/bio-vcf.1.gz |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/VERSION |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/bin/bio-vcf |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/bedfilter.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/pcows.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/template.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/utils.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/variant.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcf.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcffile.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfgenotypefield.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfheader.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfheader_line.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfline.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfrdf.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfrecord.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfsample.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf/vcfstatistics.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/bio-vcf.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/regressiontest/cli_exec.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/lib/regressiontest.rb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/ragel/gen_vcfheaderline_parser.rl |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/ragel/generate.sh |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/gatk_vcf2rdf.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/vcf2json.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/vcf2json_full_header.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/vcf2json_use_meta.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/vcf2rdf.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/gems/bio-vcf-0.9.5/template/vcf2rdf_header.erb |
| ./usr/share/rubygems-integration/all/specifications/bio-vcf-0.9.5.gemspec |