معرفی شرکت ها

abacas_1.3.1-9_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

close gaps in genomic alignments from short reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main all
نام بسته abacas
نام فایل بسته abacas_1.3.1-9_all.deb
نسخه بسته 1.3.1
انتشار بسته 9
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://abacas.sourceforge.net/
مجوز -
حجم دانلود 24640
حجم نصب 109
ABACAS (Algorithm Based Automatic Contiguation of Assembled Sequences) intends to rapidly contiguate (align, order, orientate), visualize and design primers to close gaps on shotgun assembled contigs based on a reference sequence. . ABACAS uses MUMmer to find alignment positions and identify syntenies of assembled contigs against the reference. The output is then processed to generate a pseudomolecule taking overlapping contigs and gaps in to account. ABACAS generates a comparison file that can be used to visualize ordered and oriented contigs in ACT. Synteny is represented by red bars where colour intensity decreases with lower values of percent identity between comparable blocks. Information on contigs such as the orientation, percent identity, coverage and overlap with other contigs can also be visualized by loading the outputted feature file on ACT.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
abacas-examples_1.3.1-9_all.deb 1.3.1 all Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- mummer


نحوه نصب


نصب پکیج deb abacas:

    sudo apt-get install abacas_1.3.1-9_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/abacas
./usr/share/doc/abacas/Manual.html
./usr/share/doc/abacas/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/abacas/copyright
./usr/share/doc/abacas/style.css
./usr/share/doc-base/abacas
./usr/share/man/man1/abacas.1.gz